Protein–RNA interactions for Protein: Q9D024

Ccdc47, Coiled-coil domain-containing protein 47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc47Q9D024 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc47Q9D024 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc47Q9D024 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc47Q9D024 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc47Q9D024 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc47Q9D024 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc47Q9D024 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc47Q9D024 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc47Q9D024 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc47Q9D024 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc47Q9D024 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc47Q9D024 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc47Q9D024 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc47Q9D024 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc47Q9D024 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc47Q9D024 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc47Q9D024 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc47Q9D024 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Ccdc47Q9D024 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Ccdc47Q9D024 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Ccdc47Q9D024 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Ccdc47Q9D024 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc47Q9D024 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc47Q9D024 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc47Q9D024 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc47Q9D024 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc47Q9D024 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc47Q9D024 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc47Q9D024 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc47Q9D024 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc47Q9D024 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc47Q9D024 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc47Q9D024 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc47Q9D024 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc47Q9D024 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc47Q9D024 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc47Q9D024 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc47Q9D024 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc47Q9D024 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc47Q9D024 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc47Q9D024 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc47Q9D024 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc47Q9D024 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc47Q9D024 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc47Q9D024 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc47Q9D024 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc47Q9D024 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc47Q9D024 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc47Q9D024 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc47Q9D024 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc47Q9D024 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc47Q9D024 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc47Q9D024 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc47Q9D024 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc47Q9D024 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc47Q9D024 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc47Q9D024 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc47Q9D024 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc47Q9D024 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc47Q9D024 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc47Q9D024 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc47Q9D024 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc47Q9D024 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc47Q9D024 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc47Q9D024 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc47Q9D024 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc47Q9D024 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc47Q9D024 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc47Q9D024 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc47Q9D024 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc47Q9D024 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc47Q9D024 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc47Q9D024 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc47Q9D024 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc47Q9D024 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc47Q9D024 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc47Q9D024 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc47Q9D024 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc47Q9D024 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc47Q9D024 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc47Q9D024 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc47Q9D024 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc47Q9D024 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc47Q9D024 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc47Q9D024 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc47Q9D024 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc47Q9D024 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc47Q9D024 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc47Q9D024 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc47Q9D024 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc47Q9D024 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc47Q9D024 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc47Q9D024 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc47Q9D024 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc47Q9D024 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc47Q9D024 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc47Q9D024 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc47Q9D024 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc47Q9D024 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc47Q9D024 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
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