Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZB3

Thumpd2, THUMP domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thumpd2Q9CZB3 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Thumpd2Q9CZB3 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Thumpd2Q9CZB3 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Thumpd2Q9CZB3 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Thumpd2Q9CZB3 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Thumpd2Q9CZB3 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Thumpd2Q9CZB3 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Thumpd2Q9CZB3 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Thumpd2Q9CZB3 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Thumpd2Q9CZB3 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Thumpd2Q9CZB3 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Thumpd2Q9CZB3 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Thumpd2Q9CZB3 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Thumpd2Q9CZB3 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Thumpd2Q9CZB3 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Thumpd2Q9CZB3 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Thumpd2Q9CZB3 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Thumpd2Q9CZB3 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Thumpd2Q9CZB3 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Thumpd2Q9CZB3 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Thumpd2Q9CZB3 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Thumpd2Q9CZB3 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Thumpd2Q9CZB3 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Thumpd2Q9CZB3 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Thumpd2Q9CZB3 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Thumpd2Q9CZB3 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Thumpd2Q9CZB3 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Thumpd2Q9CZB3 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Thumpd2Q9CZB3 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Thumpd2Q9CZB3 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Thumpd2Q9CZB3 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Thumpd2Q9CZB3 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Thumpd2Q9CZB3 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Thumpd2Q9CZB3 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Thumpd2Q9CZB3 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Thumpd2Q9CZB3 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Thumpd2Q9CZB3 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Thumpd2Q9CZB3 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Thumpd2Q9CZB3 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Thumpd2Q9CZB3 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Thumpd2Q9CZB3 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Thumpd2Q9CZB3 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Thumpd2Q9CZB3 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Thumpd2Q9CZB3 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Thumpd2Q9CZB3 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Thumpd2Q9CZB3 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Thumpd2Q9CZB3 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Thumpd2Q9CZB3 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Thumpd2Q9CZB3 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Thumpd2Q9CZB3 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Thumpd2Q9CZB3 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Thumpd2Q9CZB3 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Thumpd2Q9CZB3 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Thumpd2Q9CZB3 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Thumpd2Q9CZB3 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Thumpd2Q9CZB3 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Thumpd2Q9CZB3 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Thumpd2Q9CZB3 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Thumpd2Q9CZB3 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Thumpd2Q9CZB3 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Thumpd2Q9CZB3 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Thumpd2Q9CZB3 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Thumpd2Q9CZB3 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Thumpd2Q9CZB3 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Thumpd2Q9CZB3 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Thumpd2Q9CZB3 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Thumpd2Q9CZB3 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Thumpd2Q9CZB3 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Thumpd2Q9CZB3 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Thumpd2Q9CZB3 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Thumpd2Q9CZB3 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Thumpd2Q9CZB3 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Thumpd2Q9CZB3 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Thumpd2Q9CZB3 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Thumpd2Q9CZB3 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Thumpd2Q9CZB3 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Thumpd2Q9CZB3 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Thumpd2Q9CZB3 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Thumpd2Q9CZB3 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Thumpd2Q9CZB3 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Thumpd2Q9CZB3 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Thumpd2Q9CZB3 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Thumpd2Q9CZB3 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Thumpd2Q9CZB3 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Thumpd2Q9CZB3 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Thumpd2Q9CZB3 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Thumpd2Q9CZB3 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Thumpd2Q9CZB3 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Thumpd2Q9CZB3 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Thumpd2Q9CZB3 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Thumpd2Q9CZB3 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Thumpd2Q9CZB3 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Thumpd2Q9CZB3 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Thumpd2Q9CZB3 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Thumpd2Q9CZB3 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Thumpd2Q9CZB3 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Thumpd2Q9CZB3 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Thumpd2Q9CZB3 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Thumpd2Q9CZB3 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Thumpd2Q9CZB3 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms