Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY25

Mis12, Protein MIS12 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mis12Q9CY25 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Mis12Q9CY25 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Mis12Q9CY25 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Mis12Q9CY25 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Mis12Q9CY25 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Mis12Q9CY25 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Mis12Q9CY25 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Mis12Q9CY25 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Mis12Q9CY25 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Mis12Q9CY25 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Mis12Q9CY25 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Mis12Q9CY25 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Mis12Q9CY25 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Mis12Q9CY25 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Mis12Q9CY25 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Mis12Q9CY25 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Mis12Q9CY25 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Mis12Q9CY25 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Mis12Q9CY25 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Mis12Q9CY25 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Mis12Q9CY25 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Mis12Q9CY25 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Mis12Q9CY25 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Mis12Q9CY25 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Mis12Q9CY25 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Mis12Q9CY25 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Mis12Q9CY25 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Mis12Q9CY25 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Mis12Q9CY25 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Mis12Q9CY25 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Mis12Q9CY25 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Mis12Q9CY25 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Mis12Q9CY25 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Mis12Q9CY25 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Mis12Q9CY25 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Mis12Q9CY25 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Mis12Q9CY25 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Mis12Q9CY25 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Mis12Q9CY25 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Mis12Q9CY25 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Mis12Q9CY25 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Mis12Q9CY25 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Mis12Q9CY25 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mis12Q9CY25 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mis12Q9CY25 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mis12Q9CY25 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mis12Q9CY25 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mis12Q9CY25 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mis12Q9CY25 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mis12Q9CY25 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mis12Q9CY25 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mis12Q9CY25 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mis12Q9CY25 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mis12Q9CY25 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mis12Q9CY25 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mis12Q9CY25 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mis12Q9CY25 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mis12Q9CY25 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mis12Q9CY25 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mis12Q9CY25 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mis12Q9CY25 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mis12Q9CY25 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mis12Q9CY25 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mis12Q9CY25 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mis12Q9CY25 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mis12Q9CY25 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mis12Q9CY25 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mis12Q9CY25 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Mis12Q9CY25 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mis12Q9CY25 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mis12Q9CY25 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mis12Q9CY25 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mis12Q9CY25 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mis12Q9CY25 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Mis12Q9CY25 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Mis12Q9CY25 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Mis12Q9CY25 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Mis12Q9CY25 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Mis12Q9CY25 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Mis12Q9CY25 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Mis12Q9CY25 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Mis12Q9CY25 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Mis12Q9CY25 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Mis12Q9CY25 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Mis12Q9CY25 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Mis12Q9CY25 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Mis12Q9CY25 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Mis12Q9CY25 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Mis12Q9CY25 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Mis12Q9CY25 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Mis12Q9CY25 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Mis12Q9CY25 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Mis12Q9CY25 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Mis12Q9CY25 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Mis12Q9CY25 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Mis12Q9CY25 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Mis12Q9CY25 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Mis12Q9CY25 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Mis12Q9CY25 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Mis12Q9CY25 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.5 ms