Protein–RNA interactions for Protein: Q9CX11

Utp23, rRNA-processing protein UTP23 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Utp23Q9CX11 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Utp23Q9CX11 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Utp23Q9CX11 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Utp23Q9CX11 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Utp23Q9CX11 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Utp23Q9CX11 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Utp23Q9CX11 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Utp23Q9CX11 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Utp23Q9CX11 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Utp23Q9CX11 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Utp23Q9CX11 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Utp23Q9CX11 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Utp23Q9CX11 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Utp23Q9CX11 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Utp23Q9CX11 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Utp23Q9CX11 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Utp23Q9CX11 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Utp23Q9CX11 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Utp23Q9CX11 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Utp23Q9CX11 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Utp23Q9CX11 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Utp23Q9CX11 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Utp23Q9CX11 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Utp23Q9CX11 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Utp23Q9CX11 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Utp23Q9CX11 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Utp23Q9CX11 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Utp23Q9CX11 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Utp23Q9CX11 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Utp23Q9CX11 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Utp23Q9CX11 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Utp23Q9CX11 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Utp23Q9CX11 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Utp23Q9CX11 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Utp23Q9CX11 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Utp23Q9CX11 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Utp23Q9CX11 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Utp23Q9CX11 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Utp23Q9CX11 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Utp23Q9CX11 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Utp23Q9CX11 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Utp23Q9CX11 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Utp23Q9CX11 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Utp23Q9CX11 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Utp23Q9CX11 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Utp23Q9CX11 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Utp23Q9CX11 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Utp23Q9CX11 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Utp23Q9CX11 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Utp23Q9CX11 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Utp23Q9CX11 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Utp23Q9CX11 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Utp23Q9CX11 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Utp23Q9CX11 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Utp23Q9CX11 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Utp23Q9CX11 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Utp23Q9CX11 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Utp23Q9CX11 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Utp23Q9CX11 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Utp23Q9CX11 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Utp23Q9CX11 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Utp23Q9CX11 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Utp23Q9CX11 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Utp23Q9CX11 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Utp23Q9CX11 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Utp23Q9CX11 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Utp23Q9CX11 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Utp23Q9CX11 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Utp23Q9CX11 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Utp23Q9CX11 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Utp23Q9CX11 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Utp23Q9CX11 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Utp23Q9CX11 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Utp23Q9CX11 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Utp23Q9CX11 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Utp23Q9CX11 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Utp23Q9CX11 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Utp23Q9CX11 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Utp23Q9CX11 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Utp23Q9CX11 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Utp23Q9CX11 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Utp23Q9CX11 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Utp23Q9CX11 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Utp23Q9CX11 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Utp23Q9CX11 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Utp23Q9CX11 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Utp23Q9CX11 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Utp23Q9CX11 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Utp23Q9CX11 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Utp23Q9CX11 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Utp23Q9CX11 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Utp23Q9CX11 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Utp23Q9CX11 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Utp23Q9CX11 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Utp23Q9CX11 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Utp23Q9CX11 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Utp23Q9CX11 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Utp23Q9CX11 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Utp23Q9CX11 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Utp23Q9CX11 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms