Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWW7

Cxxc1, CXXC-type zinc finger protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 660 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxxc1Q9CWW7 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cxxc1Q9CWW7 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cxxc1Q9CWW7 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cxxc1Q9CWW7 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cxxc1Q9CWW7 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cxxc1Q9CWW7 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cxxc1Q9CWW7 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cxxc1Q9CWW7 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cxxc1Q9CWW7 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cxxc1Q9CWW7 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cxxc1Q9CWW7 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cxxc1Q9CWW7 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cxxc1Q9CWW7 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cxxc1Q9CWW7 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cxxc1Q9CWW7 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cxxc1Q9CWW7 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cxxc1Q9CWW7 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cxxc1Q9CWW7 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cxxc1Q9CWW7 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cxxc1Q9CWW7 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cxxc1Q9CWW7 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cxxc1Q9CWW7 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cxxc1Q9CWW7 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cxxc1Q9CWW7 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cxxc1Q9CWW7 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Cxxc1Q9CWW7 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cxxc1Q9CWW7 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cxxc1Q9CWW7 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
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Cxxc1Q9CWW7 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Cxxc1Q9CWW7 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Cxxc1Q9CWW7 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Cxxc1Q9CWW7 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cxxc1Q9CWW7 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Cxxc1Q9CWW7 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Cxxc1Q9CWW7 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Cxxc1Q9CWW7 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Cxxc1Q9CWW7 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Cxxc1Q9CWW7 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Cxxc1Q9CWW7 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Cxxc1Q9CWW7 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Cxxc1Q9CWW7 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Cxxc1Q9CWW7 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
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Cxxc1Q9CWW7 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cxxc1Q9CWW7 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cxxc1Q9CWW7 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cxxc1Q9CWW7 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cxxc1Q9CWW7 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
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Cxxc1Q9CWW7 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cxxc1Q9CWW7 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
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Cxxc1Q9CWW7 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cxxc1Q9CWW7 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cxxc1Q9CWW7 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cxxc1Q9CWW7 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cxxc1Q9CWW7 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cxxc1Q9CWW7 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
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Cxxc1Q9CWW7 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cxxc1Q9CWW7 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
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Cxxc1Q9CWW7 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cxxc1Q9CWW7 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cxxc1Q9CWW7 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cxxc1Q9CWW7 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cxxc1Q9CWW7 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cxxc1Q9CWW7 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cxxc1Q9CWW7 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cxxc1Q9CWW7 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cxxc1Q9CWW7 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cxxc1Q9CWW7 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cxxc1Q9CWW7 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cxxc1Q9CWW7 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
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Cxxc1Q9CWW7 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cxxc1Q9CWW7 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Cxxc1Q9CWW7 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cxxc1Q9CWW7 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cxxc1Q9CWW7 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cxxc1Q9CWW7 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cxxc1Q9CWW7 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cxxc1Q9CWW7 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cxxc1Q9CWW7 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cxxc1Q9CWW7 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cxxc1Q9CWW7 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cxxc1Q9CWW7 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cxxc1Q9CWW7 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cxxc1Q9CWW7 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cxxc1Q9CWW7 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cxxc1Q9CWW7 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cxxc1Q9CWW7 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
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