Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWU0

Tdrd12, Putative ATP-dependent RNA helicase TDRD12, mousemouse

Predictions only

Length 1,215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd12Q9CWU0 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tdrd12Q9CWU0 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tdrd12Q9CWU0 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Tdrd12Q9CWU0 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tdrd12Q9CWU0 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tdrd12Q9CWU0 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tdrd12Q9CWU0 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tdrd12Q9CWU0 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tdrd12Q9CWU0 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tdrd12Q9CWU0 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tdrd12Q9CWU0 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tdrd12Q9CWU0 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tdrd12Q9CWU0 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tdrd12Q9CWU0 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tdrd12Q9CWU0 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tdrd12Q9CWU0 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tdrd12Q9CWU0 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tdrd12Q9CWU0 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tdrd12Q9CWU0 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tdrd12Q9CWU0 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tdrd12Q9CWU0 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tdrd12Q9CWU0 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tdrd12Q9CWU0 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tdrd12Q9CWU0 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tdrd12Q9CWU0 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tdrd12Q9CWU0 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tdrd12Q9CWU0 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tdrd12Q9CWU0 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Tdrd12Q9CWU0 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tdrd12Q9CWU0 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tdrd12Q9CWU0 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tdrd12Q9CWU0 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tdrd12Q9CWU0 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tdrd12Q9CWU0 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tdrd12Q9CWU0 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tdrd12Q9CWU0 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tdrd12Q9CWU0 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tdrd12Q9CWU0 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tdrd12Q9CWU0 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tdrd12Q9CWU0 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tdrd12Q9CWU0 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tdrd12Q9CWU0 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tdrd12Q9CWU0 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tdrd12Q9CWU0 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tdrd12Q9CWU0 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tdrd12Q9CWU0 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tdrd12Q9CWU0 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tdrd12Q9CWU0 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tdrd12Q9CWU0 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tdrd12Q9CWU0 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tdrd12Q9CWU0 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tdrd12Q9CWU0 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tdrd12Q9CWU0 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tdrd12Q9CWU0 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tdrd12Q9CWU0 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tdrd12Q9CWU0 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tdrd12Q9CWU0 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tdrd12Q9CWU0 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tdrd12Q9CWU0 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tdrd12Q9CWU0 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tdrd12Q9CWU0 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Tdrd12Q9CWU0 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tdrd12Q9CWU0 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tdrd12Q9CWU0 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tdrd12Q9CWU0 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tdrd12Q9CWU0 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tdrd12Q9CWU0 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tdrd12Q9CWU0 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tdrd12Q9CWU0 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tdrd12Q9CWU0 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tdrd12Q9CWU0 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tdrd12Q9CWU0 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tdrd12Q9CWU0 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tdrd12Q9CWU0 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tdrd12Q9CWU0 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tdrd12Q9CWU0 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tdrd12Q9CWU0 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tdrd12Q9CWU0 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tdrd12Q9CWU0 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tdrd12Q9CWU0 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tdrd12Q9CWU0 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tdrd12Q9CWU0 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tdrd12Q9CWU0 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tdrd12Q9CWU0 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tdrd12Q9CWU0 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Tdrd12Q9CWU0 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Tdrd12Q9CWU0 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tdrd12Q9CWU0 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tdrd12Q9CWU0 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tdrd12Q9CWU0 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tdrd12Q9CWU0 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tdrd12Q9CWU0 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tdrd12Q9CWU0 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tdrd12Q9CWU0 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tdrd12Q9CWU0 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tdrd12Q9CWU0 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tdrd12Q9CWU0 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tdrd12Q9CWU0 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Tdrd12Q9CWU0 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tdrd12Q9CWU0 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms