Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWP8

Pold4, DNA polymerase delta subunit 4, mousemouse

Predictions only

Length 107 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pold4Q9CWP8 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pold4Q9CWP8 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pold4Q9CWP8 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pold4Q9CWP8 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pold4Q9CWP8 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pold4Q9CWP8 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Pold4Q9CWP8 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pold4Q9CWP8 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pold4Q9CWP8 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pold4Q9CWP8 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pold4Q9CWP8 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pold4Q9CWP8 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pold4Q9CWP8 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Pold4Q9CWP8 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pold4Q9CWP8 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pold4Q9CWP8 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pold4Q9CWP8 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pold4Q9CWP8 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pold4Q9CWP8 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pold4Q9CWP8 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pold4Q9CWP8 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pold4Q9CWP8 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pold4Q9CWP8 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pold4Q9CWP8 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pold4Q9CWP8 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pold4Q9CWP8 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pold4Q9CWP8 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pold4Q9CWP8 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pold4Q9CWP8 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pold4Q9CWP8 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Pold4Q9CWP8 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Pold4Q9CWP8 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pold4Q9CWP8 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pold4Q9CWP8 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pold4Q9CWP8 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pold4Q9CWP8 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pold4Q9CWP8 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pold4Q9CWP8 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pold4Q9CWP8 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pold4Q9CWP8 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pold4Q9CWP8 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pold4Q9CWP8 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pold4Q9CWP8 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pold4Q9CWP8 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pold4Q9CWP8 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pold4Q9CWP8 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pold4Q9CWP8 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pold4Q9CWP8 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pold4Q9CWP8 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Pold4Q9CWP8 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pold4Q9CWP8 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pold4Q9CWP8 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pold4Q9CWP8 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pold4Q9CWP8 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pold4Q9CWP8 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pold4Q9CWP8 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pold4Q9CWP8 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pold4Q9CWP8 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pold4Q9CWP8 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pold4Q9CWP8 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pold4Q9CWP8 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pold4Q9CWP8 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pold4Q9CWP8 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Pold4Q9CWP8 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pold4Q9CWP8 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pold4Q9CWP8 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pold4Q9CWP8 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pold4Q9CWP8 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pold4Q9CWP8 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pold4Q9CWP8 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pold4Q9CWP8 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Pold4Q9CWP8 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Pold4Q9CWP8 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pold4Q9CWP8 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pold4Q9CWP8 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pold4Q9CWP8 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pold4Q9CWP8 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pold4Q9CWP8 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pold4Q9CWP8 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pold4Q9CWP8 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pold4Q9CWP8 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pold4Q9CWP8 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pold4Q9CWP8 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pold4Q9CWP8 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pold4Q9CWP8 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pold4Q9CWP8 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pold4Q9CWP8 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pold4Q9CWP8 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pold4Q9CWP8 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pold4Q9CWP8 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pold4Q9CWP8 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pold4Q9CWP8 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pold4Q9CWP8 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pold4Q9CWP8 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pold4Q9CWP8 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pold4Q9CWP8 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pold4Q9CWP8 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pold4Q9CWP8 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pold4Q9CWP8 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pold4Q9CWP8 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms