Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWN7

Cnot11, CCR4-NOT transcription complex subunit 11, mousemouse

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Length 505 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot11Q9CWN7 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
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Cnot11Q9CWN7 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cnot11Q9CWN7 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cnot11Q9CWN7 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cnot11Q9CWN7 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
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Cnot11Q9CWN7 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cnot11Q9CWN7 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cnot11Q9CWN7 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cnot11Q9CWN7 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
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Cnot11Q9CWN7 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
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Cnot11Q9CWN7 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cnot11Q9CWN7 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cnot11Q9CWN7 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cnot11Q9CWN7 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cnot11Q9CWN7 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cnot11Q9CWN7 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cnot11Q9CWN7 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cnot11Q9CWN7 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cnot11Q9CWN7 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
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Cnot11Q9CWN7 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cnot11Q9CWN7 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
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Cnot11Q9CWN7 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cnot11Q9CWN7 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
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Cnot11Q9CWN7 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cnot11Q9CWN7 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
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