Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWD8

Nubpl, Iron-sulfur protein NUBPL, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NubplQ9CWD8 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
NubplQ9CWD8 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
NubplQ9CWD8 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
NubplQ9CWD8 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
NubplQ9CWD8 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
NubplQ9CWD8 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
NubplQ9CWD8 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
NubplQ9CWD8 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
NubplQ9CWD8 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
NubplQ9CWD8 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
NubplQ9CWD8 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
NubplQ9CWD8 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
NubplQ9CWD8 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
NubplQ9CWD8 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
NubplQ9CWD8 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
NubplQ9CWD8 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
NubplQ9CWD8 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
NubplQ9CWD8 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
NubplQ9CWD8 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
NubplQ9CWD8 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
NubplQ9CWD8 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
NubplQ9CWD8 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
NubplQ9CWD8 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
NubplQ9CWD8 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
NubplQ9CWD8 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
NubplQ9CWD8 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
NubplQ9CWD8 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
NubplQ9CWD8 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
NubplQ9CWD8 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
NubplQ9CWD8 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC14.3□□□□□ -0.12
NubplQ9CWD8 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
NubplQ9CWD8 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
NubplQ9CWD8 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
NubplQ9CWD8 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
NubplQ9CWD8 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
NubplQ9CWD8 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
NubplQ9CWD8 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
NubplQ9CWD8 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
NubplQ9CWD8 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
NubplQ9CWD8 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
NubplQ9CWD8 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
NubplQ9CWD8 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
NubplQ9CWD8 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
NubplQ9CWD8 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
NubplQ9CWD8 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
NubplQ9CWD8 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
NubplQ9CWD8 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
NubplQ9CWD8 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
NubplQ9CWD8 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
NubplQ9CWD8 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
NubplQ9CWD8 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
NubplQ9CWD8 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
NubplQ9CWD8 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
NubplQ9CWD8 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
NubplQ9CWD8 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
NubplQ9CWD8 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
NubplQ9CWD8 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
NubplQ9CWD8 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
NubplQ9CWD8 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
NubplQ9CWD8 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
NubplQ9CWD8 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
NubplQ9CWD8 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
NubplQ9CWD8 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
NubplQ9CWD8 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
NubplQ9CWD8 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
NubplQ9CWD8 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
NubplQ9CWD8 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
NubplQ9CWD8 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
NubplQ9CWD8 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
NubplQ9CWD8 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
NubplQ9CWD8 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
NubplQ9CWD8 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC14.29□□□□□ -0.12
NubplQ9CWD8 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
NubplQ9CWD8 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
NubplQ9CWD8 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
NubplQ9CWD8 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
NubplQ9CWD8 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC14.29□□□□□ -0.12
NubplQ9CWD8 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC14.29□□□□□ -0.12
NubplQ9CWD8 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
NubplQ9CWD8 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
NubplQ9CWD8 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
NubplQ9CWD8 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
NubplQ9CWD8 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
NubplQ9CWD8 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
NubplQ9CWD8 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
NubplQ9CWD8 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
NubplQ9CWD8 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
NubplQ9CWD8 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
NubplQ9CWD8 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
NubplQ9CWD8 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC14.28□□□□□ -0.12
NubplQ9CWD8 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
NubplQ9CWD8 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
NubplQ9CWD8 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
NubplQ9CWD8 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
NubplQ9CWD8 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
NubplQ9CWD8 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
NubplQ9CWD8 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
NubplQ9CWD8 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
NubplQ9CWD8 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
NubplQ9CWD8 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms