Protein–RNA interactions for Protein: Q9CV28

MINDY3, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase MINDY-3, mousemouse

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Length 444 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MINDY3Q9CV28 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
MINDY3Q9CV28 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
MINDY3Q9CV28 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
MINDY3Q9CV28 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
MINDY3Q9CV28 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
MINDY3Q9CV28 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
MINDY3Q9CV28 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
MINDY3Q9CV28 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
MINDY3Q9CV28 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
MINDY3Q9CV28 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
MINDY3Q9CV28 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
MINDY3Q9CV28 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
MINDY3Q9CV28 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
MINDY3Q9CV28 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
MINDY3Q9CV28 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
MINDY3Q9CV28 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
MINDY3Q9CV28 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
MINDY3Q9CV28 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
MINDY3Q9CV28 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
MINDY3Q9CV28 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
MINDY3Q9CV28 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
MINDY3Q9CV28 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
MINDY3Q9CV28 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
MINDY3Q9CV28 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
MINDY3Q9CV28 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
MINDY3Q9CV28 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
MINDY3Q9CV28 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
MINDY3Q9CV28 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
MINDY3Q9CV28 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
MINDY3Q9CV28 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
MINDY3Q9CV28 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
MINDY3Q9CV28 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
MINDY3Q9CV28 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
MINDY3Q9CV28 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
MINDY3Q9CV28 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
MINDY3Q9CV28 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
MINDY3Q9CV28 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
MINDY3Q9CV28 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
MINDY3Q9CV28 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
MINDY3Q9CV28 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
MINDY3Q9CV28 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
MINDY3Q9CV28 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
MINDY3Q9CV28 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
MINDY3Q9CV28 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
MINDY3Q9CV28 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
MINDY3Q9CV28 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
MINDY3Q9CV28 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
MINDY3Q9CV28 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
MINDY3Q9CV28 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
MINDY3Q9CV28 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
MINDY3Q9CV28 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
MINDY3Q9CV28 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
MINDY3Q9CV28 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
MINDY3Q9CV28 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
MINDY3Q9CV28 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
MINDY3Q9CV28 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
MINDY3Q9CV28 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
MINDY3Q9CV28 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
MINDY3Q9CV28 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
MINDY3Q9CV28 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
MINDY3Q9CV28 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
MINDY3Q9CV28 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
MINDY3Q9CV28 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
MINDY3Q9CV28 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
MINDY3Q9CV28 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
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MINDY3Q9CV28 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
MINDY3Q9CV28 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
MINDY3Q9CV28 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
MINDY3Q9CV28 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
MINDY3Q9CV28 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.02
MINDY3Q9CV28 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
MINDY3Q9CV28 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
MINDY3Q9CV28 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
MINDY3Q9CV28 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
MINDY3Q9CV28 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
MINDY3Q9CV28 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
MINDY3Q9CV28 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
MINDY3Q9CV28 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
MINDY3Q9CV28 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
MINDY3Q9CV28 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
MINDY3Q9CV28 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
MINDY3Q9CV28 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
MINDY3Q9CV28 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
MINDY3Q9CV28 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
MINDY3Q9CV28 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
MINDY3Q9CV28 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
MINDY3Q9CV28 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
MINDY3Q9CV28 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
MINDY3Q9CV28 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
MINDY3Q9CV28 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
MINDY3Q9CV28 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
MINDY3Q9CV28 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
MINDY3Q9CV28 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
MINDY3Q9CV28 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
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