Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUU3

Sycp2, Synaptonemal complex protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sycp2Q9CUU3 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Sycp2Q9CUU3 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Sycp2Q9CUU3 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Sycp2Q9CUU3 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Sycp2Q9CUU3 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Sycp2Q9CUU3 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Sycp2Q9CUU3 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Sycp2Q9CUU3 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Sycp2Q9CUU3 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Sycp2Q9CUU3 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Sycp2Q9CUU3 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Sycp2Q9CUU3 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Sycp2Q9CUU3 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Sycp2Q9CUU3 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Sycp2Q9CUU3 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Sycp2Q9CUU3 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
Sycp2Q9CUU3 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Sycp2Q9CUU3 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Sycp2Q9CUU3 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Sycp2Q9CUU3 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Sycp2Q9CUU3 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Sycp2Q9CUU3 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Sycp2Q9CUU3 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
Sycp2Q9CUU3 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Sycp2Q9CUU3 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
Sycp2Q9CUU3 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Sycp2Q9CUU3 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Sycp2Q9CUU3 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Sycp2Q9CUU3 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Sycp2Q9CUU3 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Sycp2Q9CUU3 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Sycp2Q9CUU3 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Sycp2Q9CUU3 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Sycp2Q9CUU3 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Sycp2Q9CUU3 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Sycp2Q9CUU3 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Sycp2Q9CUU3 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Sycp2Q9CUU3 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Sycp2Q9CUU3 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
Sycp2Q9CUU3 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Sycp2Q9CUU3 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Sycp2Q9CUU3 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Sycp2Q9CUU3 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Sycp2Q9CUU3 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Sycp2Q9CUU3 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Sycp2Q9CUU3 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Sycp2Q9CUU3 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
Sycp2Q9CUU3 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
Sycp2Q9CUU3 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Sycp2Q9CUU3 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Sycp2Q9CUU3 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Sycp2Q9CUU3 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Sycp2Q9CUU3 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Sycp2Q9CUU3 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Sycp2Q9CUU3 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Sycp2Q9CUU3 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Sycp2Q9CUU3 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
Sycp2Q9CUU3 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Sycp2Q9CUU3 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Sycp2Q9CUU3 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Sycp2Q9CUU3 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Sycp2Q9CUU3 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Sycp2Q9CUU3 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Sycp2Q9CUU3 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Sycp2Q9CUU3 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Sycp2Q9CUU3 Crym-201ENSMUST00000033198 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Sycp2Q9CUU3 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Sycp2Q9CUU3 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
Sycp2Q9CUU3 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Sycp2Q9CUU3 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Sycp2Q9CUU3 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Sycp2Q9CUU3 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
Sycp2Q9CUU3 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Sycp2Q9CUU3 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
Sycp2Q9CUU3 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Sycp2Q9CUU3 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
Sycp2Q9CUU3 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
Sycp2Q9CUU3 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Sycp2Q9CUU3 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Sycp2Q9CUU3 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Sycp2Q9CUU3 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Sycp2Q9CUU3 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Sycp2Q9CUU3 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Sycp2Q9CUU3 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Sycp2Q9CUU3 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Sycp2Q9CUU3 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Sycp2Q9CUU3 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Sycp2Q9CUU3 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Sycp2Q9CUU3 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Sycp2Q9CUU3 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Sycp2Q9CUU3 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Sycp2Q9CUU3 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Sycp2Q9CUU3 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Sycp2Q9CUU3 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Sycp2Q9CUU3 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
Sycp2Q9CUU3 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Sycp2Q9CUU3 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Sycp2Q9CUU3 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Sycp2Q9CUU3 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Sycp2Q9CUU3 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.6 ms