Protein–RNA interactions for Protein: Q9CTN4

Rhobtb3, Rho-related BTB domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 611 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhobtb3Q9CTN4 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rhobtb3Q9CTN4 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rhobtb3Q9CTN4 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rhobtb3Q9CTN4 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rhobtb3Q9CTN4 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rhobtb3Q9CTN4 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rhobtb3Q9CTN4 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Rhobtb3Q9CTN4 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rhobtb3Q9CTN4 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rhobtb3Q9CTN4 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rhobtb3Q9CTN4 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Rhobtb3Q9CTN4 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rhobtb3Q9CTN4 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rhobtb3Q9CTN4 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rhobtb3Q9CTN4 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rhobtb3Q9CTN4 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rhobtb3Q9CTN4 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rhobtb3Q9CTN4 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rhobtb3Q9CTN4 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rhobtb3Q9CTN4 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rhobtb3Q9CTN4 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rhobtb3Q9CTN4 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rhobtb3Q9CTN4 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rhobtb3Q9CTN4 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rhobtb3Q9CTN4 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rhobtb3Q9CTN4 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rhobtb3Q9CTN4 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rhobtb3Q9CTN4 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rhobtb3Q9CTN4 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rhobtb3Q9CTN4 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rhobtb3Q9CTN4 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rhobtb3Q9CTN4 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rhobtb3Q9CTN4 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rhobtb3Q9CTN4 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rhobtb3Q9CTN4 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rhobtb3Q9CTN4 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rhobtb3Q9CTN4 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rhobtb3Q9CTN4 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rhobtb3Q9CTN4 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rhobtb3Q9CTN4 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rhobtb3Q9CTN4 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rhobtb3Q9CTN4 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rhobtb3Q9CTN4 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rhobtb3Q9CTN4 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rhobtb3Q9CTN4 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rhobtb3Q9CTN4 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rhobtb3Q9CTN4 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rhobtb3Q9CTN4 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rhobtb3Q9CTN4 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rhobtb3Q9CTN4 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rhobtb3Q9CTN4 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rhobtb3Q9CTN4 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Rhobtb3Q9CTN4 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rhobtb3Q9CTN4 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rhobtb3Q9CTN4 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rhobtb3Q9CTN4 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rhobtb3Q9CTN4 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rhobtb3Q9CTN4 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rhobtb3Q9CTN4 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rhobtb3Q9CTN4 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rhobtb3Q9CTN4 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rhobtb3Q9CTN4 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rhobtb3Q9CTN4 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rhobtb3Q9CTN4 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Rhobtb3Q9CTN4 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rhobtb3Q9CTN4 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rhobtb3Q9CTN4 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rhobtb3Q9CTN4 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rhobtb3Q9CTN4 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rhobtb3Q9CTN4 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rhobtb3Q9CTN4 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rhobtb3Q9CTN4 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rhobtb3Q9CTN4 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rhobtb3Q9CTN4 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rhobtb3Q9CTN4 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rhobtb3Q9CTN4 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rhobtb3Q9CTN4 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rhobtb3Q9CTN4 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rhobtb3Q9CTN4 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rhobtb3Q9CTN4 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rhobtb3Q9CTN4 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Rhobtb3Q9CTN4 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rhobtb3Q9CTN4 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rhobtb3Q9CTN4 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rhobtb3Q9CTN4 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rhobtb3Q9CTN4 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rhobtb3Q9CTN4 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rhobtb3Q9CTN4 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rhobtb3Q9CTN4 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rhobtb3Q9CTN4 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rhobtb3Q9CTN4 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Rhobtb3Q9CTN4 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rhobtb3Q9CTN4 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rhobtb3Q9CTN4 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rhobtb3Q9CTN4 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rhobtb3Q9CTN4 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rhobtb3Q9CTN4 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rhobtb3Q9CTN4 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rhobtb3Q9CTN4 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rhobtb3Q9CTN4 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.8 ms