Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSU0

Rprd1b, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rprd1bQ9CSU0 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rprd1bQ9CSU0 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rprd1bQ9CSU0 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rprd1bQ9CSU0 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rprd1bQ9CSU0 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rprd1bQ9CSU0 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rprd1bQ9CSU0 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rprd1bQ9CSU0 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rprd1bQ9CSU0 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rprd1bQ9CSU0 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rprd1bQ9CSU0 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rprd1bQ9CSU0 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rprd1bQ9CSU0 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rprd1bQ9CSU0 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rprd1bQ9CSU0 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rprd1bQ9CSU0 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rprd1bQ9CSU0 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rprd1bQ9CSU0 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rprd1bQ9CSU0 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rprd1bQ9CSU0 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rprd1bQ9CSU0 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Rprd1bQ9CSU0 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rprd1bQ9CSU0 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rprd1bQ9CSU0 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rprd1bQ9CSU0 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rprd1bQ9CSU0 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rprd1bQ9CSU0 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rprd1bQ9CSU0 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Rprd1bQ9CSU0 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Rprd1bQ9CSU0 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rprd1bQ9CSU0 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rprd1bQ9CSU0 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rprd1bQ9CSU0 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rprd1bQ9CSU0 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rprd1bQ9CSU0 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rprd1bQ9CSU0 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rprd1bQ9CSU0 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rprd1bQ9CSU0 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rprd1bQ9CSU0 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rprd1bQ9CSU0 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rprd1bQ9CSU0 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rprd1bQ9CSU0 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rprd1bQ9CSU0 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rprd1bQ9CSU0 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rprd1bQ9CSU0 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rprd1bQ9CSU0 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rprd1bQ9CSU0 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rprd1bQ9CSU0 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rprd1bQ9CSU0 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rprd1bQ9CSU0 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rprd1bQ9CSU0 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rprd1bQ9CSU0 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rprd1bQ9CSU0 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rprd1bQ9CSU0 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rprd1bQ9CSU0 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rprd1bQ9CSU0 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Rprd1bQ9CSU0 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rprd1bQ9CSU0 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rprd1bQ9CSU0 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Rprd1bQ9CSU0 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rprd1bQ9CSU0 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rprd1bQ9CSU0 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rprd1bQ9CSU0 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rprd1bQ9CSU0 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rprd1bQ9CSU0 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rprd1bQ9CSU0 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rprd1bQ9CSU0 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rprd1bQ9CSU0 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rprd1bQ9CSU0 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rprd1bQ9CSU0 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Rprd1bQ9CSU0 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rprd1bQ9CSU0 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rprd1bQ9CSU0 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rprd1bQ9CSU0 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rprd1bQ9CSU0 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rprd1bQ9CSU0 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rprd1bQ9CSU0 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rprd1bQ9CSU0 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rprd1bQ9CSU0 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rprd1bQ9CSU0 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rprd1bQ9CSU0 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rprd1bQ9CSU0 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Rprd1bQ9CSU0 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rprd1bQ9CSU0 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rprd1bQ9CSU0 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rprd1bQ9CSU0 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rprd1bQ9CSU0 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rprd1bQ9CSU0 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rprd1bQ9CSU0 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Rprd1bQ9CSU0 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rprd1bQ9CSU0 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rprd1bQ9CSU0 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rprd1bQ9CSU0 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rprd1bQ9CSU0 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rprd1bQ9CSU0 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Rprd1bQ9CSU0 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Rprd1bQ9CSU0 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Rprd1bQ9CSU0 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Rprd1bQ9CSU0 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Rprd1bQ9CSU0 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
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