Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSN1

Snw1, SNW domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 536 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snw1Q9CSN1 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Snw1Q9CSN1 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Snw1Q9CSN1 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Snw1Q9CSN1 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Snw1Q9CSN1 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Snw1Q9CSN1 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Snw1Q9CSN1 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Snw1Q9CSN1 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Snw1Q9CSN1 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Snw1Q9CSN1 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Snw1Q9CSN1 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Snw1Q9CSN1 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Snw1Q9CSN1 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Snw1Q9CSN1 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Snw1Q9CSN1 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Snw1Q9CSN1 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Snw1Q9CSN1 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Snw1Q9CSN1 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Snw1Q9CSN1 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Snw1Q9CSN1 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Snw1Q9CSN1 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Snw1Q9CSN1 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Snw1Q9CSN1 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Snw1Q9CSN1 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Snw1Q9CSN1 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Snw1Q9CSN1 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Snw1Q9CSN1 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Snw1Q9CSN1 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Snw1Q9CSN1 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Snw1Q9CSN1 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Snw1Q9CSN1 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Snw1Q9CSN1 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Snw1Q9CSN1 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Snw1Q9CSN1 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Snw1Q9CSN1 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Snw1Q9CSN1 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Snw1Q9CSN1 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Snw1Q9CSN1 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Snw1Q9CSN1 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Snw1Q9CSN1 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Snw1Q9CSN1 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Snw1Q9CSN1 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Snw1Q9CSN1 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Snw1Q9CSN1 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Snw1Q9CSN1 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Snw1Q9CSN1 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Snw1Q9CSN1 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Snw1Q9CSN1 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Snw1Q9CSN1 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Snw1Q9CSN1 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Snw1Q9CSN1 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Snw1Q9CSN1 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Snw1Q9CSN1 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Snw1Q9CSN1 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Snw1Q9CSN1 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Snw1Q9CSN1 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Snw1Q9CSN1 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Snw1Q9CSN1 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Snw1Q9CSN1 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Snw1Q9CSN1 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Snw1Q9CSN1 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Snw1Q9CSN1 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Snw1Q9CSN1 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Snw1Q9CSN1 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Snw1Q9CSN1 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Snw1Q9CSN1 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Snw1Q9CSN1 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Snw1Q9CSN1 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Snw1Q9CSN1 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Snw1Q9CSN1 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Snw1Q9CSN1 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Snw1Q9CSN1 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Snw1Q9CSN1 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Snw1Q9CSN1 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Snw1Q9CSN1 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Snw1Q9CSN1 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Snw1Q9CSN1 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Snw1Q9CSN1 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Snw1Q9CSN1 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Snw1Q9CSN1 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Snw1Q9CSN1 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Snw1Q9CSN1 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Snw1Q9CSN1 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Snw1Q9CSN1 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Snw1Q9CSN1 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Snw1Q9CSN1 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Snw1Q9CSN1 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Snw1Q9CSN1 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Snw1Q9CSN1 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Snw1Q9CSN1 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Snw1Q9CSN1 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Snw1Q9CSN1 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Snw1Q9CSN1 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Snw1Q9CSN1 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Snw1Q9CSN1 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Snw1Q9CSN1 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Snw1Q9CSN1 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Snw1Q9CSN1 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Snw1Q9CSN1 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Snw1Q9CSN1 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.3 ms