Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQQ7

Atp5f1, ATP synthase F(0) complex subunit B1, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 256 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp5f1Q9CQQ7 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Atp5f1Q9CQQ7 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Atp5f1Q9CQQ7 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Atp5f1Q9CQQ7 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Atp5f1Q9CQQ7 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Atp5f1Q9CQQ7 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Atp5f1Q9CQQ7 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Atp5f1Q9CQQ7 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Atp5f1Q9CQQ7 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Atp5f1Q9CQQ7 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Atp5f1Q9CQQ7 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Atp5f1Q9CQQ7 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Atp5f1Q9CQQ7 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Atp5f1Q9CQQ7 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Atp5f1Q9CQQ7 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Atp5f1Q9CQQ7 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Atp5f1Q9CQQ7 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Atp5f1Q9CQQ7 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Atp5f1Q9CQQ7 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Atp5f1Q9CQQ7 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Atp5f1Q9CQQ7 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Atp5f1Q9CQQ7 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Atp5f1Q9CQQ7 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Atp5f1Q9CQQ7 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Atp5f1Q9CQQ7 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Atp5f1Q9CQQ7 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Atp5f1Q9CQQ7 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Atp5f1Q9CQQ7 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Atp5f1Q9CQQ7 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Atp5f1Q9CQQ7 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Atp5f1Q9CQQ7 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Atp5f1Q9CQQ7 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Atp5f1Q9CQQ7 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Atp5f1Q9CQQ7 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Atp5f1Q9CQQ7 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Atp5f1Q9CQQ7 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Atp5f1Q9CQQ7 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Atp5f1Q9CQQ7 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Atp5f1Q9CQQ7 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Atp5f1Q9CQQ7 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Atp5f1Q9CQQ7 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Atp5f1Q9CQQ7 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Atp5f1Q9CQQ7 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Atp5f1Q9CQQ7 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Atp5f1Q9CQQ7 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Atp5f1Q9CQQ7 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Atp5f1Q9CQQ7 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Atp5f1Q9CQQ7 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Atp5f1Q9CQQ7 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Atp5f1Q9CQQ7 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Atp5f1Q9CQQ7 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Atp5f1Q9CQQ7 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Atp5f1Q9CQQ7 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Atp5f1Q9CQQ7 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Atp5f1Q9CQQ7 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Atp5f1Q9CQQ7 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Atp5f1Q9CQQ7 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Atp5f1Q9CQQ7 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Atp5f1Q9CQQ7 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Atp5f1Q9CQQ7 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Atp5f1Q9CQQ7 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Atp5f1Q9CQQ7 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Atp5f1Q9CQQ7 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Atp5f1Q9CQQ7 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Atp5f1Q9CQQ7 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Atp5f1Q9CQQ7 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Atp5f1Q9CQQ7 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Atp5f1Q9CQQ7 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Atp5f1Q9CQQ7 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Atp5f1Q9CQQ7 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Atp5f1Q9CQQ7 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Atp5f1Q9CQQ7 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Atp5f1Q9CQQ7 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Atp5f1Q9CQQ7 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Atp5f1Q9CQQ7 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Atp5f1Q9CQQ7 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Atp5f1Q9CQQ7 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Atp5f1Q9CQQ7 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Atp5f1Q9CQQ7 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Atp5f1Q9CQQ7 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Atp5f1Q9CQQ7 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Atp5f1Q9CQQ7 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Atp5f1Q9CQQ7 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Atp5f1Q9CQQ7 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Atp5f1Q9CQQ7 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Atp5f1Q9CQQ7 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Atp5f1Q9CQQ7 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Atp5f1Q9CQQ7 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Atp5f1Q9CQQ7 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Atp5f1Q9CQQ7 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Atp5f1Q9CQQ7 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Atp5f1Q9CQQ7 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Atp5f1Q9CQQ7 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Atp5f1Q9CQQ7 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Atp5f1Q9CQQ7 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Atp5f1Q9CQQ7 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Atp5f1Q9CQQ7 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Atp5f1Q9CQQ7 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Atp5f1Q9CQQ7 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Atp5f1Q9CQQ7 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.2 ms