Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQK3

Rdm1, RAD52 motif-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 281 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdm1Q9CQK3 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rdm1Q9CQK3 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rdm1Q9CQK3 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rdm1Q9CQK3 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rdm1Q9CQK3 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rdm1Q9CQK3 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rdm1Q9CQK3 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rdm1Q9CQK3 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rdm1Q9CQK3 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rdm1Q9CQK3 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rdm1Q9CQK3 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rdm1Q9CQK3 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rdm1Q9CQK3 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rdm1Q9CQK3 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rdm1Q9CQK3 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rdm1Q9CQK3 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rdm1Q9CQK3 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Rdm1Q9CQK3 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rdm1Q9CQK3 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rdm1Q9CQK3 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rdm1Q9CQK3 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rdm1Q9CQK3 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Rdm1Q9CQK3 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rdm1Q9CQK3 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Rdm1Q9CQK3 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rdm1Q9CQK3 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rdm1Q9CQK3 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rdm1Q9CQK3 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rdm1Q9CQK3 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rdm1Q9CQK3 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rdm1Q9CQK3 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rdm1Q9CQK3 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rdm1Q9CQK3 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rdm1Q9CQK3 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rdm1Q9CQK3 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rdm1Q9CQK3 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Rdm1Q9CQK3 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rdm1Q9CQK3 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rdm1Q9CQK3 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rdm1Q9CQK3 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rdm1Q9CQK3 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rdm1Q9CQK3 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rdm1Q9CQK3 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rdm1Q9CQK3 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rdm1Q9CQK3 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rdm1Q9CQK3 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rdm1Q9CQK3 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rdm1Q9CQK3 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rdm1Q9CQK3 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rdm1Q9CQK3 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rdm1Q9CQK3 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rdm1Q9CQK3 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rdm1Q9CQK3 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rdm1Q9CQK3 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rdm1Q9CQK3 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rdm1Q9CQK3 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rdm1Q9CQK3 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rdm1Q9CQK3 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rdm1Q9CQK3 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rdm1Q9CQK3 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Rdm1Q9CQK3 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rdm1Q9CQK3 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rdm1Q9CQK3 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rdm1Q9CQK3 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rdm1Q9CQK3 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rdm1Q9CQK3 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rdm1Q9CQK3 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rdm1Q9CQK3 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
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Rdm1Q9CQK3 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rdm1Q9CQK3 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Rdm1Q9CQK3 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Rdm1Q9CQK3 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
Rdm1Q9CQK3 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Rdm1Q9CQK3 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Rdm1Q9CQK3 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Rdm1Q9CQK3 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Rdm1Q9CQK3 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Rdm1Q9CQK3 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Rdm1Q9CQK3 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Rdm1Q9CQK3 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Rdm1Q9CQK3 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Rdm1Q9CQK3 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Rdm1Q9CQK3 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Rdm1Q9CQK3 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Rdm1Q9CQK3 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Rdm1Q9CQK3 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Rdm1Q9CQK3 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Rdm1Q9CQK3 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Rdm1Q9CQK3 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Rdm1Q9CQK3 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Rdm1Q9CQK3 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rdm1Q9CQK3 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rdm1Q9CQK3 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rdm1Q9CQK3 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rdm1Q9CQK3 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rdm1Q9CQK3 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rdm1Q9CQK3 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rdm1Q9CQK3 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rdm1Q9CQK3 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
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