Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQI7

Snrpb2, U2 small nuclear ribonucleoprotein B'', mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrpb2Q9CQI7 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Snrpb2Q9CQI7 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Snrpb2Q9CQI7 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Snrpb2Q9CQI7 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Snrpb2Q9CQI7 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Snrpb2Q9CQI7 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Snrpb2Q9CQI7 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Snrpb2Q9CQI7 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Snrpb2Q9CQI7 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Snrpb2Q9CQI7 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Snrpb2Q9CQI7 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Snrpb2Q9CQI7 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Snrpb2Q9CQI7 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Snrpb2Q9CQI7 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Snrpb2Q9CQI7 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Snrpb2Q9CQI7 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Snrpb2Q9CQI7 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Snrpb2Q9CQI7 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Snrpb2Q9CQI7 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Snrpb2Q9CQI7 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Snrpb2Q9CQI7 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Snrpb2Q9CQI7 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Snrpb2Q9CQI7 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Snrpb2Q9CQI7 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Snrpb2Q9CQI7 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Snrpb2Q9CQI7 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Snrpb2Q9CQI7 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Snrpb2Q9CQI7 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Snrpb2Q9CQI7 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Snrpb2Q9CQI7 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Snrpb2Q9CQI7 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Snrpb2Q9CQI7 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Snrpb2Q9CQI7 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Snrpb2Q9CQI7 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Snrpb2Q9CQI7 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Snrpb2Q9CQI7 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Snrpb2Q9CQI7 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Snrpb2Q9CQI7 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Snrpb2Q9CQI7 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Snrpb2Q9CQI7 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Snrpb2Q9CQI7 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Snrpb2Q9CQI7 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Snrpb2Q9CQI7 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Snrpb2Q9CQI7 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Snrpb2Q9CQI7 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Snrpb2Q9CQI7 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Snrpb2Q9CQI7 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Snrpb2Q9CQI7 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Snrpb2Q9CQI7 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Snrpb2Q9CQI7 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Snrpb2Q9CQI7 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Snrpb2Q9CQI7 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Snrpb2Q9CQI7 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Snrpb2Q9CQI7 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Snrpb2Q9CQI7 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Snrpb2Q9CQI7 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Snrpb2Q9CQI7 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Snrpb2Q9CQI7 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Snrpb2Q9CQI7 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Snrpb2Q9CQI7 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Snrpb2Q9CQI7 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Snrpb2Q9CQI7 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Snrpb2Q9CQI7 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Snrpb2Q9CQI7 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Snrpb2Q9CQI7 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Snrpb2Q9CQI7 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Snrpb2Q9CQI7 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Snrpb2Q9CQI7 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Snrpb2Q9CQI7 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Snrpb2Q9CQI7 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Snrpb2Q9CQI7 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Snrpb2Q9CQI7 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Snrpb2Q9CQI7 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snrpb2Q9CQI7 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snrpb2Q9CQI7 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snrpb2Q9CQI7 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snrpb2Q9CQI7 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Snrpb2Q9CQI7 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snrpb2Q9CQI7 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snrpb2Q9CQI7 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snrpb2Q9CQI7 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snrpb2Q9CQI7 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snrpb2Q9CQI7 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snrpb2Q9CQI7 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snrpb2Q9CQI7 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snrpb2Q9CQI7 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snrpb2Q9CQI7 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Snrpb2Q9CQI7 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snrpb2Q9CQI7 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snrpb2Q9CQI7 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snrpb2Q9CQI7 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snrpb2Q9CQI7 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snrpb2Q9CQI7 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snrpb2Q9CQI7 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Snrpb2Q9CQI7 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snrpb2Q9CQI7 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snrpb2Q9CQI7 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snrpb2Q9CQI7 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snrpb2Q9CQI7 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snrpb2Q9CQI7 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms