Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQH0

Pdzk1ip1, PDZK1-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 114 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzk1ip1Q9CQH0 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pdzk1ip1Q9CQH0 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pdzk1ip1Q9CQH0 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pdzk1ip1Q9CQH0 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pdzk1ip1Q9CQH0 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pdzk1ip1Q9CQH0 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pdzk1ip1Q9CQH0 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pdzk1ip1Q9CQH0 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pdzk1ip1Q9CQH0 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pdzk1ip1Q9CQH0 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pdzk1ip1Q9CQH0 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pdzk1ip1Q9CQH0 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pdzk1ip1Q9CQH0 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pdzk1ip1Q9CQH0 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pdzk1ip1Q9CQH0 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pdzk1ip1Q9CQH0 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Pdzk1ip1Q9CQH0 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pdzk1ip1Q9CQH0 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pdzk1ip1Q9CQH0 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pdzk1ip1Q9CQH0 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pdzk1ip1Q9CQH0 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pdzk1ip1Q9CQH0 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pdzk1ip1Q9CQH0 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pdzk1ip1Q9CQH0 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pdzk1ip1Q9CQH0 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pdzk1ip1Q9CQH0 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pdzk1ip1Q9CQH0 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pdzk1ip1Q9CQH0 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pdzk1ip1Q9CQH0 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Pdzk1ip1Q9CQH0 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Pdzk1ip1Q9CQH0 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Pdzk1ip1Q9CQH0 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Pdzk1ip1Q9CQH0 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Pdzk1ip1Q9CQH0 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Pdzk1ip1Q9CQH0 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Pdzk1ip1Q9CQH0 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Pdzk1ip1Q9CQH0 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Pdzk1ip1Q9CQH0 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pdzk1ip1Q9CQH0 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pdzk1ip1Q9CQH0 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pdzk1ip1Q9CQH0 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pdzk1ip1Q9CQH0 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pdzk1ip1Q9CQH0 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pdzk1ip1Q9CQH0 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pdzk1ip1Q9CQH0 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pdzk1ip1Q9CQH0 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pdzk1ip1Q9CQH0 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pdzk1ip1Q9CQH0 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pdzk1ip1Q9CQH0 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pdzk1ip1Q9CQH0 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pdzk1ip1Q9CQH0 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pdzk1ip1Q9CQH0 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pdzk1ip1Q9CQH0 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pdzk1ip1Q9CQH0 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pdzk1ip1Q9CQH0 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pdzk1ip1Q9CQH0 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pdzk1ip1Q9CQH0 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pdzk1ip1Q9CQH0 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Pdzk1ip1Q9CQH0 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Pdzk1ip1Q9CQH0 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pdzk1ip1Q9CQH0 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pdzk1ip1Q9CQH0 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pdzk1ip1Q9CQH0 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pdzk1ip1Q9CQH0 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pdzk1ip1Q9CQH0 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pdzk1ip1Q9CQH0 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
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