Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQE1

Nipsnap3b, Protein NipSnap homolog 3B, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nipsnap3bQ9CQE1 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nipsnap3bQ9CQE1 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nipsnap3bQ9CQE1 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nipsnap3bQ9CQE1 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nipsnap3bQ9CQE1 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nipsnap3bQ9CQE1 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nipsnap3bQ9CQE1 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nipsnap3bQ9CQE1 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nipsnap3bQ9CQE1 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nipsnap3bQ9CQE1 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nipsnap3bQ9CQE1 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nipsnap3bQ9CQE1 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nipsnap3bQ9CQE1 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nipsnap3bQ9CQE1 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nipsnap3bQ9CQE1 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nipsnap3bQ9CQE1 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nipsnap3bQ9CQE1 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nipsnap3bQ9CQE1 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nipsnap3bQ9CQE1 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nipsnap3bQ9CQE1 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nipsnap3bQ9CQE1 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nipsnap3bQ9CQE1 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nipsnap3bQ9CQE1 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nipsnap3bQ9CQE1 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nipsnap3bQ9CQE1 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nipsnap3bQ9CQE1 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nipsnap3bQ9CQE1 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nipsnap3bQ9CQE1 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nipsnap3bQ9CQE1 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nipsnap3bQ9CQE1 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nipsnap3bQ9CQE1 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nipsnap3bQ9CQE1 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nipsnap3bQ9CQE1 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nipsnap3bQ9CQE1 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nipsnap3bQ9CQE1 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nipsnap3bQ9CQE1 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nipsnap3bQ9CQE1 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nipsnap3bQ9CQE1 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nipsnap3bQ9CQE1 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nipsnap3bQ9CQE1 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nipsnap3bQ9CQE1 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nipsnap3bQ9CQE1 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nipsnap3bQ9CQE1 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nipsnap3bQ9CQE1 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nipsnap3bQ9CQE1 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nipsnap3bQ9CQE1 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nipsnap3bQ9CQE1 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nipsnap3bQ9CQE1 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nipsnap3bQ9CQE1 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nipsnap3bQ9CQE1 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nipsnap3bQ9CQE1 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Nipsnap3bQ9CQE1 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nipsnap3bQ9CQE1 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nipsnap3bQ9CQE1 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nipsnap3bQ9CQE1 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Nipsnap3bQ9CQE1 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nipsnap3bQ9CQE1 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nipsnap3bQ9CQE1 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nipsnap3bQ9CQE1 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nipsnap3bQ9CQE1 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nipsnap3bQ9CQE1 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nipsnap3bQ9CQE1 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nipsnap3bQ9CQE1 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nipsnap3bQ9CQE1 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nipsnap3bQ9CQE1 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nipsnap3bQ9CQE1 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nipsnap3bQ9CQE1 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nipsnap3bQ9CQE1 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nipsnap3bQ9CQE1 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nipsnap3bQ9CQE1 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nipsnap3bQ9CQE1 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Nipsnap3bQ9CQE1 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nipsnap3bQ9CQE1 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nipsnap3bQ9CQE1 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nipsnap3bQ9CQE1 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nipsnap3bQ9CQE1 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nipsnap3bQ9CQE1 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nipsnap3bQ9CQE1 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nipsnap3bQ9CQE1 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nipsnap3bQ9CQE1 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nipsnap3bQ9CQE1 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Nipsnap3bQ9CQE1 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Nipsnap3bQ9CQE1 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Nipsnap3bQ9CQE1 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Nipsnap3bQ9CQE1 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nipsnap3bQ9CQE1 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nipsnap3bQ9CQE1 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nipsnap3bQ9CQE1 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nipsnap3bQ9CQE1 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms