Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQD8

Atp6v0e1, V-type proton ATPase subunit e 1, mousemouse

Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp6v0e1Q9CQD8 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Atp6v0e1Q9CQD8 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Atp6v0e1Q9CQD8 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Atp6v0e1Q9CQD8 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Atp6v0e1Q9CQD8 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Atp6v0e1Q9CQD8 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Atp6v0e1Q9CQD8 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Atp6v0e1Q9CQD8 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Atp6v0e1Q9CQD8 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Atp6v0e1Q9CQD8 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Atp6v0e1Q9CQD8 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Atp6v0e1Q9CQD8 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Atp6v0e1Q9CQD8 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Atp6v0e1Q9CQD8 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Atp6v0e1Q9CQD8 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Atp6v0e1Q9CQD8 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Atp6v0e1Q9CQD8 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Atp6v0e1Q9CQD8 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Atp6v0e1Q9CQD8 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Atp6v0e1Q9CQD8 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Atp6v0e1Q9CQD8 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Atp6v0e1Q9CQD8 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Atp6v0e1Q9CQD8 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Atp6v0e1Q9CQD8 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Atp6v0e1Q9CQD8 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Atp6v0e1Q9CQD8 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Atp6v0e1Q9CQD8 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Atp6v0e1Q9CQD8 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Atp6v0e1Q9CQD8 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Atp6v0e1Q9CQD8 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Atp6v0e1Q9CQD8 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Atp6v0e1Q9CQD8 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Atp6v0e1Q9CQD8 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Atp6v0e1Q9CQD8 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Atp6v0e1Q9CQD8 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Atp6v0e1Q9CQD8 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Atp6v0e1Q9CQD8 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Atp6v0e1Q9CQD8 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Atp6v0e1Q9CQD8 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Atp6v0e1Q9CQD8 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Atp6v0e1Q9CQD8 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Atp6v0e1Q9CQD8 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Atp6v0e1Q9CQD8 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Atp6v0e1Q9CQD8 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Atp6v0e1Q9CQD8 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Atp6v0e1Q9CQD8 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Atp6v0e1Q9CQD8 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Atp6v0e1Q9CQD8 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Atp6v0e1Q9CQD8 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Atp6v0e1Q9CQD8 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Atp6v0e1Q9CQD8 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Atp6v0e1Q9CQD8 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Atp6v0e1Q9CQD8 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Atp6v0e1Q9CQD8 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Atp6v0e1Q9CQD8 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Atp6v0e1Q9CQD8 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Atp6v0e1Q9CQD8 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Atp6v0e1Q9CQD8 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Atp6v0e1Q9CQD8 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Atp6v0e1Q9CQD8 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Atp6v0e1Q9CQD8 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Atp6v0e1Q9CQD8 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Atp6v0e1Q9CQD8 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Atp6v0e1Q9CQD8 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Atp6v0e1Q9CQD8 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Atp6v0e1Q9CQD8 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Atp6v0e1Q9CQD8 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Atp6v0e1Q9CQD8 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Atp6v0e1Q9CQD8 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Atp6v0e1Q9CQD8 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Atp6v0e1Q9CQD8 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Atp6v0e1Q9CQD8 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Atp6v0e1Q9CQD8 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Atp6v0e1Q9CQD8 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Atp6v0e1Q9CQD8 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Atp6v0e1Q9CQD8 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Atp6v0e1Q9CQD8 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Atp6v0e1Q9CQD8 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Atp6v0e1Q9CQD8 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Atp6v0e1Q9CQD8 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Atp6v0e1Q9CQD8 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Atp6v0e1Q9CQD8 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Atp6v0e1Q9CQD8 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Atp6v0e1Q9CQD8 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.7 ms