Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQC3

Protein C9orf135 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CQC3 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q9CQC3 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Q9CQC3 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q9CQC3 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q9CQC3 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q9CQC3 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q9CQC3 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q9CQC3 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q9CQC3 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q9CQC3 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q9CQC3 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q9CQC3 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q9CQC3 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q9CQC3 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q9CQC3 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q9CQC3 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q9CQC3 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q9CQC3 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q9CQC3 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q9CQC3 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q9CQC3 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q9CQC3 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q9CQC3 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q9CQC3 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q9CQC3 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Q9CQC3 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q9CQC3 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q9CQC3 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q9CQC3 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q9CQC3 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q9CQC3 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q9CQC3 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q9CQC3 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q9CQC3 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q9CQC3 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q9CQC3 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q9CQC3 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q9CQC3 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q9CQC3 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q9CQC3 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q9CQC3 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q9CQC3 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q9CQC3 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q9CQC3 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q9CQC3 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q9CQC3 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q9CQC3 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q9CQC3 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q9CQC3 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q9CQC3 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q9CQC3 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q9CQC3 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q9CQC3 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q9CQC3 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q9CQC3 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q9CQC3 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q9CQC3 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q9CQC3 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q9CQC3 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q9CQC3 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q9CQC3 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q9CQC3 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q9CQC3 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q9CQC3 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q9CQC3 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q9CQC3 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q9CQC3 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q9CQC3 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q9CQC3 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q9CQC3 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q9CQC3 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q9CQC3 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q9CQC3 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q9CQC3 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q9CQC3 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Q9CQC3 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q9CQC3 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q9CQC3 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Q9CQC3 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q9CQC3 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q9CQC3 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q9CQC3 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q9CQC3 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q9CQC3 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q9CQC3 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q9CQC3 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q9CQC3 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q9CQC3 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q9CQC3 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q9CQC3 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q9CQC3 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q9CQC3 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q9CQC3 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q9CQC3 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q9CQC3 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q9CQC3 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q9CQC3 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q9CQC3 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q9CQC3 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q9CQC3 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms