Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ73

Pkp2, Plakophilin 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 795 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp2Q9CQ73 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
Pkp2Q9CQ73 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pkp2Q9CQ73 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pkp2Q9CQ73 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pkp2Q9CQ73 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Pkp2Q9CQ73 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pkp2Q9CQ73 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Pkp2Q9CQ73 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pkp2Q9CQ73 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pkp2Q9CQ73 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Pkp2Q9CQ73 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Pkp2Q9CQ73 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pkp2Q9CQ73 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pkp2Q9CQ73 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pkp2Q9CQ73 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pkp2Q9CQ73 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Pkp2Q9CQ73 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pkp2Q9CQ73 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pkp2Q9CQ73 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pkp2Q9CQ73 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pkp2Q9CQ73 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Pkp2Q9CQ73 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pkp2Q9CQ73 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pkp2Q9CQ73 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pkp2Q9CQ73 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pkp2Q9CQ73 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pkp2Q9CQ73 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pkp2Q9CQ73 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pkp2Q9CQ73 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pkp2Q9CQ73 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pkp2Q9CQ73 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pkp2Q9CQ73 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pkp2Q9CQ73 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pkp2Q9CQ73 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pkp2Q9CQ73 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pkp2Q9CQ73 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Pkp2Q9CQ73 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pkp2Q9CQ73 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Pkp2Q9CQ73 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pkp2Q9CQ73 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pkp2Q9CQ73 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Pkp2Q9CQ73 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pkp2Q9CQ73 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pkp2Q9CQ73 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Pkp2Q9CQ73 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Pkp2Q9CQ73 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pkp2Q9CQ73 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Pkp2Q9CQ73 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pkp2Q9CQ73 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pkp2Q9CQ73 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pkp2Q9CQ73 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pkp2Q9CQ73 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pkp2Q9CQ73 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pkp2Q9CQ73 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pkp2Q9CQ73 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pkp2Q9CQ73 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Pkp2Q9CQ73 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pkp2Q9CQ73 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pkp2Q9CQ73 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pkp2Q9CQ73 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pkp2Q9CQ73 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pkp2Q9CQ73 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pkp2Q9CQ73 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pkp2Q9CQ73 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pkp2Q9CQ73 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pkp2Q9CQ73 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pkp2Q9CQ73 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pkp2Q9CQ73 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pkp2Q9CQ73 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pkp2Q9CQ73 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Pkp2Q9CQ73 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pkp2Q9CQ73 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Pkp2Q9CQ73 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pkp2Q9CQ73 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pkp2Q9CQ73 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pkp2Q9CQ73 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Pkp2Q9CQ73 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pkp2Q9CQ73 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pkp2Q9CQ73 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pkp2Q9CQ73 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pkp2Q9CQ73 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pkp2Q9CQ73 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pkp2Q9CQ73 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Pkp2Q9CQ73 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pkp2Q9CQ73 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pkp2Q9CQ73 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pkp2Q9CQ73 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pkp2Q9CQ73 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pkp2Q9CQ73 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pkp2Q9CQ73 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pkp2Q9CQ73 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pkp2Q9CQ73 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pkp2Q9CQ73 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pkp2Q9CQ73 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pkp2Q9CQ73 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pkp2Q9CQ73 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pkp2Q9CQ73 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pkp2Q9CQ73 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pkp2Q9CQ73 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Pkp2Q9CQ73 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms