Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ56

Use1, Vesicle transport protein USE1, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Use1Q9CQ56 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Use1Q9CQ56 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Use1Q9CQ56 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Use1Q9CQ56 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Use1Q9CQ56 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Use1Q9CQ56 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Use1Q9CQ56 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Use1Q9CQ56 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Use1Q9CQ56 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Use1Q9CQ56 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Use1Q9CQ56 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Use1Q9CQ56 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Use1Q9CQ56 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Use1Q9CQ56 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Use1Q9CQ56 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Use1Q9CQ56 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Use1Q9CQ56 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Use1Q9CQ56 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Use1Q9CQ56 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Use1Q9CQ56 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Use1Q9CQ56 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Use1Q9CQ56 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Use1Q9CQ56 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Use1Q9CQ56 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Use1Q9CQ56 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Use1Q9CQ56 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Use1Q9CQ56 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
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Use1Q9CQ56 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Use1Q9CQ56 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Use1Q9CQ56 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Use1Q9CQ56 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Use1Q9CQ56 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Use1Q9CQ56 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Use1Q9CQ56 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Use1Q9CQ56 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
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Use1Q9CQ56 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
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Use1Q9CQ56 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
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Use1Q9CQ56 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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Use1Q9CQ56 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Use1Q9CQ56 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Use1Q9CQ56 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Use1Q9CQ56 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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Use1Q9CQ56 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Use1Q9CQ56 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Use1Q9CQ56 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Use1Q9CQ56 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Use1Q9CQ56 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Use1Q9CQ56 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Use1Q9CQ56 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Use1Q9CQ56 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Use1Q9CQ56 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Use1Q9CQ56 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Use1Q9CQ56 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Use1Q9CQ56 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Use1Q9CQ56 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Use1Q9CQ56 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Use1Q9CQ56 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Use1Q9CQ56 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Use1Q9CQ56 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms