Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ26

Stambp, STAM-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
StambpQ9CQ26 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
StambpQ9CQ26 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
StambpQ9CQ26 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
StambpQ9CQ26 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
StambpQ9CQ26 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
StambpQ9CQ26 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
StambpQ9CQ26 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
StambpQ9CQ26 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
StambpQ9CQ26 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
StambpQ9CQ26 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
StambpQ9CQ26 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
StambpQ9CQ26 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
StambpQ9CQ26 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
StambpQ9CQ26 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
StambpQ9CQ26 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
StambpQ9CQ26 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
StambpQ9CQ26 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
StambpQ9CQ26 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
StambpQ9CQ26 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
StambpQ9CQ26 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
StambpQ9CQ26 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
StambpQ9CQ26 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
StambpQ9CQ26 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
StambpQ9CQ26 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
StambpQ9CQ26 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
StambpQ9CQ26 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
StambpQ9CQ26 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
StambpQ9CQ26 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
StambpQ9CQ26 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
StambpQ9CQ26 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
StambpQ9CQ26 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
StambpQ9CQ26 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
StambpQ9CQ26 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
StambpQ9CQ26 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
StambpQ9CQ26 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
StambpQ9CQ26 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
StambpQ9CQ26 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
StambpQ9CQ26 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
StambpQ9CQ26 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
StambpQ9CQ26 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
StambpQ9CQ26 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
StambpQ9CQ26 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
StambpQ9CQ26 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
StambpQ9CQ26 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
StambpQ9CQ26 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
StambpQ9CQ26 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
StambpQ9CQ26 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
StambpQ9CQ26 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
StambpQ9CQ26 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
StambpQ9CQ26 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
StambpQ9CQ26 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
StambpQ9CQ26 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
StambpQ9CQ26 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
StambpQ9CQ26 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
StambpQ9CQ26 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
StambpQ9CQ26 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
StambpQ9CQ26 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
StambpQ9CQ26 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
StambpQ9CQ26 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
StambpQ9CQ26 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
StambpQ9CQ26 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
StambpQ9CQ26 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
StambpQ9CQ26 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
StambpQ9CQ26 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
StambpQ9CQ26 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
StambpQ9CQ26 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
StambpQ9CQ26 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
StambpQ9CQ26 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
StambpQ9CQ26 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
StambpQ9CQ26 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
StambpQ9CQ26 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
StambpQ9CQ26 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
StambpQ9CQ26 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
StambpQ9CQ26 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
StambpQ9CQ26 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
StambpQ9CQ26 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
StambpQ9CQ26 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
StambpQ9CQ26 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
StambpQ9CQ26 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
StambpQ9CQ26 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
StambpQ9CQ26 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
StambpQ9CQ26 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
StambpQ9CQ26 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
StambpQ9CQ26 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
StambpQ9CQ26 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
StambpQ9CQ26 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
StambpQ9CQ26 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
StambpQ9CQ26 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
StambpQ9CQ26 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
StambpQ9CQ26 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
StambpQ9CQ26 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
StambpQ9CQ26 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
StambpQ9CQ26 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
StambpQ9CQ26 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
StambpQ9CQ26 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
StambpQ9CQ26 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
StambpQ9CQ26 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
StambpQ9CQ26 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
StambpQ9CQ26 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
StambpQ9CQ26 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.3 ms