Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPX6

Atg3, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG3, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg3Q9CPX6 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Atg3Q9CPX6 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Atg3Q9CPX6 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Atg3Q9CPX6 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Atg3Q9CPX6 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Atg3Q9CPX6 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Atg3Q9CPX6 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Atg3Q9CPX6 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Atg3Q9CPX6 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Atg3Q9CPX6 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
Atg3Q9CPX6 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Atg3Q9CPX6 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Atg3Q9CPX6 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Atg3Q9CPX6 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Atg3Q9CPX6 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Atg3Q9CPX6 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Atg3Q9CPX6 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Atg3Q9CPX6 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Atg3Q9CPX6 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Atg3Q9CPX6 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Atg3Q9CPX6 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Atg3Q9CPX6 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Atg3Q9CPX6 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Atg3Q9CPX6 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Atg3Q9CPX6 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Atg3Q9CPX6 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Atg3Q9CPX6 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
Atg3Q9CPX6 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Atg3Q9CPX6 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
Atg3Q9CPX6 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Atg3Q9CPX6 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Atg3Q9CPX6 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Atg3Q9CPX6 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Atg3Q9CPX6 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
Atg3Q9CPX6 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
Atg3Q9CPX6 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Atg3Q9CPX6 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Atg3Q9CPX6 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Atg3Q9CPX6 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Atg3Q9CPX6 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Atg3Q9CPX6 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
Atg3Q9CPX6 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Atg3Q9CPX6 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Atg3Q9CPX6 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Atg3Q9CPX6 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Atg3Q9CPX6 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Atg3Q9CPX6 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Atg3Q9CPX6 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Atg3Q9CPX6 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
Atg3Q9CPX6 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Atg3Q9CPX6 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Atg3Q9CPX6 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Atg3Q9CPX6 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Atg3Q9CPX6 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Atg3Q9CPX6 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Atg3Q9CPX6 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Atg3Q9CPX6 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Atg3Q9CPX6 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Atg3Q9CPX6 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Atg3Q9CPX6 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Atg3Q9CPX6 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Atg3Q9CPX6 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Atg3Q9CPX6 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Atg3Q9CPX6 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Atg3Q9CPX6 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Atg3Q9CPX6 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Atg3Q9CPX6 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Atg3Q9CPX6 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Atg3Q9CPX6 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Atg3Q9CPX6 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Atg3Q9CPX6 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Atg3Q9CPX6 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Atg3Q9CPX6 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Atg3Q9CPX6 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Atg3Q9CPX6 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Atg3Q9CPX6 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Atg3Q9CPX6 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Atg3Q9CPX6 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Atg3Q9CPX6 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
Atg3Q9CPX6 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Atg3Q9CPX6 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Atg3Q9CPX6 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Atg3Q9CPX6 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Atg3Q9CPX6 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Atg3Q9CPX6 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Atg3Q9CPX6 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Atg3Q9CPX6 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Atg3Q9CPX6 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Atg3Q9CPX6 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Atg3Q9CPX6 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Atg3Q9CPX6 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
Atg3Q9CPX6 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Atg3Q9CPX6 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Atg3Q9CPX6 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Atg3Q9CPX6 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Atg3Q9CPX6 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Atg3Q9CPX6 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Atg3Q9CPX6 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Atg3Q9CPX6 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Atg3Q9CPX6 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms