Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPR7

Sike1, Suppressor of IKBKE 1, mousemouse

Predictions only

Length 207 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sike1Q9CPR7 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sike1Q9CPR7 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sike1Q9CPR7 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sike1Q9CPR7 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sike1Q9CPR7 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sike1Q9CPR7 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sike1Q9CPR7 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sike1Q9CPR7 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sike1Q9CPR7 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sike1Q9CPR7 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sike1Q9CPR7 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sike1Q9CPR7 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sike1Q9CPR7 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Sike1Q9CPR7 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Sike1Q9CPR7 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Sike1Q9CPR7 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sike1Q9CPR7 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sike1Q9CPR7 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sike1Q9CPR7 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sike1Q9CPR7 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sike1Q9CPR7 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sike1Q9CPR7 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sike1Q9CPR7 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Sike1Q9CPR7 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Sike1Q9CPR7 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sike1Q9CPR7 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Sike1Q9CPR7 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Sike1Q9CPR7 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Sike1Q9CPR7 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sike1Q9CPR7 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Sike1Q9CPR7 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sike1Q9CPR7 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sike1Q9CPR7 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Sike1Q9CPR7 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Sike1Q9CPR7 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Sike1Q9CPR7 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Sike1Q9CPR7 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Sike1Q9CPR7 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Sike1Q9CPR7 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Sike1Q9CPR7 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Sike1Q9CPR7 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Sike1Q9CPR7 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sike1Q9CPR7 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Sike1Q9CPR7 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Sike1Q9CPR7 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Sike1Q9CPR7 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sike1Q9CPR7 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sike1Q9CPR7 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sike1Q9CPR7 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sike1Q9CPR7 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sike1Q9CPR7 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sike1Q9CPR7 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sike1Q9CPR7 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sike1Q9CPR7 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Sike1Q9CPR7 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sike1Q9CPR7 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sike1Q9CPR7 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sike1Q9CPR7 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sike1Q9CPR7 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sike1Q9CPR7 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sike1Q9CPR7 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sike1Q9CPR7 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sike1Q9CPR7 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Sike1Q9CPR7 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sike1Q9CPR7 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sike1Q9CPR7 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sike1Q9CPR7 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sike1Q9CPR7 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sike1Q9CPR7 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sike1Q9CPR7 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sike1Q9CPR7 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sike1Q9CPR7 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sike1Q9CPR7 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sike1Q9CPR7 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sike1Q9CPR7 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sike1Q9CPR7 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sike1Q9CPR7 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sike1Q9CPR7 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sike1Q9CPR7 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sike1Q9CPR7 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sike1Q9CPR7 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Sike1Q9CPR7 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sike1Q9CPR7 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sike1Q9CPR7 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sike1Q9CPR7 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sike1Q9CPR7 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sike1Q9CPR7 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sike1Q9CPR7 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sike1Q9CPR7 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sike1Q9CPR7 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sike1Q9CPR7 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sike1Q9CPR7 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Sike1Q9CPR7 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sike1Q9CPR7 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sike1Q9CPR7 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sike1Q9CPR7 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sike1Q9CPR7 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sike1Q9CPR7 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sike1Q9CPR7 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sike1Q9CPR7 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.3 ms