Protein–RNA interactions for Protein: Q99PV5

Bhlhe41, Class E basic helix-loop-helix protein 41, mousemouse

Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlhe41Q99PV5 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Bhlhe41Q99PV5 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Bhlhe41Q99PV5 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Bhlhe41Q99PV5 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Bhlhe41Q99PV5 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Bhlhe41Q99PV5 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Bhlhe41Q99PV5 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Bhlhe41Q99PV5 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Bhlhe41Q99PV5 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Bhlhe41Q99PV5 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Bhlhe41Q99PV5 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Bhlhe41Q99PV5 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Bhlhe41Q99PV5 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Bhlhe41Q99PV5 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Bhlhe41Q99PV5 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Bhlhe41Q99PV5 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Bhlhe41Q99PV5 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Bhlhe41Q99PV5 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Bhlhe41Q99PV5 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Bhlhe41Q99PV5 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Bhlhe41Q99PV5 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
Bhlhe41Q99PV5 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Bhlhe41Q99PV5 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Bhlhe41Q99PV5 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Bhlhe41Q99PV5 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Bhlhe41Q99PV5 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
Bhlhe41Q99PV5 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Bhlhe41Q99PV5 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Bhlhe41Q99PV5 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
Bhlhe41Q99PV5 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Bhlhe41Q99PV5 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Bhlhe41Q99PV5 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Bhlhe41Q99PV5 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Bhlhe41Q99PV5 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Bhlhe41Q99PV5 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Bhlhe41Q99PV5 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Bhlhe41Q99PV5 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Bhlhe41Q99PV5 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Bhlhe41Q99PV5 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Bhlhe41Q99PV5 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Bhlhe41Q99PV5 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Bhlhe41Q99PV5 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Bhlhe41Q99PV5 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Bhlhe41Q99PV5 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Bhlhe41Q99PV5 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Bhlhe41Q99PV5 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Bhlhe41Q99PV5 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Bhlhe41Q99PV5 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Bhlhe41Q99PV5 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Bhlhe41Q99PV5 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Bhlhe41Q99PV5 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Bhlhe41Q99PV5 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Bhlhe41Q99PV5 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
Bhlhe41Q99PV5 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Bhlhe41Q99PV5 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Bhlhe41Q99PV5 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Bhlhe41Q99PV5 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Bhlhe41Q99PV5 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Bhlhe41Q99PV5 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Bhlhe41Q99PV5 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Bhlhe41Q99PV5 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Bhlhe41Q99PV5 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Bhlhe41Q99PV5 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Bhlhe41Q99PV5 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Bhlhe41Q99PV5 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Bhlhe41Q99PV5 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Bhlhe41Q99PV5 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Bhlhe41Q99PV5 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Bhlhe41Q99PV5 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Bhlhe41Q99PV5 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Bhlhe41Q99PV5 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Bhlhe41Q99PV5 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Bhlhe41Q99PV5 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Bhlhe41Q99PV5 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Bhlhe41Q99PV5 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Bhlhe41Q99PV5 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Bhlhe41Q99PV5 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Bhlhe41Q99PV5 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Bhlhe41Q99PV5 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
Bhlhe41Q99PV5 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
Bhlhe41Q99PV5 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Bhlhe41Q99PV5 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Bhlhe41Q99PV5 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Bhlhe41Q99PV5 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Bhlhe41Q99PV5 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Bhlhe41Q99PV5 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Bhlhe41Q99PV5 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Bhlhe41Q99PV5 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Bhlhe41Q99PV5 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Bhlhe41Q99PV5 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Bhlhe41Q99PV5 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Bhlhe41Q99PV5 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Bhlhe41Q99PV5 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Bhlhe41Q99PV5 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC14.27□□□□□ -0.12
Bhlhe41Q99PV5 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Bhlhe41Q99PV5 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Bhlhe41Q99PV5 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Bhlhe41Q99PV5 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Bhlhe41Q99PV5 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Bhlhe41Q99PV5 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.1 ms