Protein–RNA interactions for Protein: Q99PM3

Gtf2a1, Transcription initiation factor IIA subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2a1Q99PM3 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gtf2a1Q99PM3 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Gtf2a1Q99PM3 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gtf2a1Q99PM3 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gtf2a1Q99PM3 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gtf2a1Q99PM3 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gtf2a1Q99PM3 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gtf2a1Q99PM3 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gtf2a1Q99PM3 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gtf2a1Q99PM3 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gtf2a1Q99PM3 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gtf2a1Q99PM3 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gtf2a1Q99PM3 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gtf2a1Q99PM3 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gtf2a1Q99PM3 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gtf2a1Q99PM3 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gtf2a1Q99PM3 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Gtf2a1Q99PM3 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gtf2a1Q99PM3 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gtf2a1Q99PM3 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gtf2a1Q99PM3 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gtf2a1Q99PM3 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gtf2a1Q99PM3 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gtf2a1Q99PM3 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gtf2a1Q99PM3 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gtf2a1Q99PM3 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gtf2a1Q99PM3 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gtf2a1Q99PM3 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gtf2a1Q99PM3 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gtf2a1Q99PM3 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gtf2a1Q99PM3 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gtf2a1Q99PM3 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gtf2a1Q99PM3 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gtf2a1Q99PM3 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gtf2a1Q99PM3 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gtf2a1Q99PM3 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gtf2a1Q99PM3 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gtf2a1Q99PM3 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gtf2a1Q99PM3 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gtf2a1Q99PM3 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gtf2a1Q99PM3 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Gtf2a1Q99PM3 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gtf2a1Q99PM3 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gtf2a1Q99PM3 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gtf2a1Q99PM3 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Gtf2a1Q99PM3 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gtf2a1Q99PM3 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gtf2a1Q99PM3 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gtf2a1Q99PM3 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gtf2a1Q99PM3 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Gtf2a1Q99PM3 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gtf2a1Q99PM3 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gtf2a1Q99PM3 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gtf2a1Q99PM3 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gtf2a1Q99PM3 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gtf2a1Q99PM3 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gtf2a1Q99PM3 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gtf2a1Q99PM3 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gtf2a1Q99PM3 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gtf2a1Q99PM3 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gtf2a1Q99PM3 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gtf2a1Q99PM3 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gtf2a1Q99PM3 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gtf2a1Q99PM3 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Gtf2a1Q99PM3 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Gtf2a1Q99PM3 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gtf2a1Q99PM3 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gtf2a1Q99PM3 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gtf2a1Q99PM3 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gtf2a1Q99PM3 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gtf2a1Q99PM3 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gtf2a1Q99PM3 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gtf2a1Q99PM3 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gtf2a1Q99PM3 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gtf2a1Q99PM3 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gtf2a1Q99PM3 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gtf2a1Q99PM3 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gtf2a1Q99PM3 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gtf2a1Q99PM3 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gtf2a1Q99PM3 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gtf2a1Q99PM3 Gm37105-201ENSMUST00000192251 2085 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Gtf2a1Q99PM3 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gtf2a1Q99PM3 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gtf2a1Q99PM3 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gtf2a1Q99PM3 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gtf2a1Q99PM3 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gtf2a1Q99PM3 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gtf2a1Q99PM3 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gtf2a1Q99PM3 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gtf2a1Q99PM3 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gtf2a1Q99PM3 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gtf2a1Q99PM3 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gtf2a1Q99PM3 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Gtf2a1Q99PM3 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gtf2a1Q99PM3 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gtf2a1Q99PM3 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gtf2a1Q99PM3 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gtf2a1Q99PM3 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gtf2a1Q99PM3 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gtf2a1Q99PM3 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.8 ms