Protein–RNA interactions for Protein: Q99PL7

Scd3, Acyl-CoA desaturase 3, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scd3Q99PL7 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Scd3Q99PL7 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Scd3Q99PL7 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Scd3Q99PL7 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Scd3Q99PL7 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Scd3Q99PL7 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Scd3Q99PL7 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Scd3Q99PL7 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Scd3Q99PL7 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Scd3Q99PL7 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Scd3Q99PL7 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Scd3Q99PL7 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Scd3Q99PL7 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Scd3Q99PL7 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Scd3Q99PL7 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Scd3Q99PL7 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Scd3Q99PL7 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Scd3Q99PL7 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Scd3Q99PL7 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Scd3Q99PL7 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Scd3Q99PL7 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Scd3Q99PL7 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Scd3Q99PL7 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Scd3Q99PL7 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Scd3Q99PL7 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Scd3Q99PL7 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Scd3Q99PL7 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Scd3Q99PL7 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Scd3Q99PL7 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Scd3Q99PL7 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Scd3Q99PL7 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Scd3Q99PL7 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Scd3Q99PL7 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Scd3Q99PL7 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Scd3Q99PL7 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Scd3Q99PL7 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Scd3Q99PL7 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Scd3Q99PL7 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Scd3Q99PL7 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Scd3Q99PL7 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Scd3Q99PL7 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Scd3Q99PL7 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Scd3Q99PL7 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Scd3Q99PL7 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Scd3Q99PL7 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Scd3Q99PL7 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Scd3Q99PL7 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Scd3Q99PL7 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Scd3Q99PL7 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Scd3Q99PL7 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Scd3Q99PL7 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Scd3Q99PL7 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Scd3Q99PL7 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Scd3Q99PL7 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Scd3Q99PL7 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Scd3Q99PL7 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Scd3Q99PL7 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Scd3Q99PL7 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Scd3Q99PL7 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Scd3Q99PL7 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Scd3Q99PL7 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Scd3Q99PL7 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Scd3Q99PL7 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Scd3Q99PL7 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Scd3Q99PL7 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Scd3Q99PL7 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Scd3Q99PL7 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Scd3Q99PL7 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Scd3Q99PL7 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Scd3Q99PL7 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Scd3Q99PL7 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Scd3Q99PL7 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Scd3Q99PL7 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Scd3Q99PL7 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Scd3Q99PL7 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Scd3Q99PL7 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Scd3Q99PL7 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Scd3Q99PL7 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Scd3Q99PL7 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Scd3Q99PL7 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Scd3Q99PL7 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Scd3Q99PL7 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Scd3Q99PL7 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Scd3Q99PL7 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Scd3Q99PL7 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Scd3Q99PL7 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
Scd3Q99PL7 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Scd3Q99PL7 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Scd3Q99PL7 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Scd3Q99PL7 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Scd3Q99PL7 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Scd3Q99PL7 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Scd3Q99PL7 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Scd3Q99PL7 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Scd3Q99PL7 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Scd3Q99PL7 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Scd3Q99PL7 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Scd3Q99PL7 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Scd3Q99PL7 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Scd3Q99PL7 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.5 ms