Protein–RNA interactions for Protein: Q99PL6

Ubxn6, UBX domain-containing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 442 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn6Q99PL6 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ubxn6Q99PL6 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ubxn6Q99PL6 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ubxn6Q99PL6 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ubxn6Q99PL6 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ubxn6Q99PL6 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ubxn6Q99PL6 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ubxn6Q99PL6 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ubxn6Q99PL6 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Ubxn6Q99PL6 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ubxn6Q99PL6 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ubxn6Q99PL6 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ubxn6Q99PL6 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Ubxn6Q99PL6 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Ubxn6Q99PL6 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ubxn6Q99PL6 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ubxn6Q99PL6 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ubxn6Q99PL6 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ubxn6Q99PL6 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ubxn6Q99PL6 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ubxn6Q99PL6 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ubxn6Q99PL6 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ubxn6Q99PL6 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ubxn6Q99PL6 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ubxn6Q99PL6 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ubxn6Q99PL6 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ubxn6Q99PL6 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ubxn6Q99PL6 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ubxn6Q99PL6 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ubxn6Q99PL6 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ubxn6Q99PL6 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ubxn6Q99PL6 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ubxn6Q99PL6 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ubxn6Q99PL6 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Ubxn6Q99PL6 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ubxn6Q99PL6 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ubxn6Q99PL6 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ubxn6Q99PL6 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ubxn6Q99PL6 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ubxn6Q99PL6 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ubxn6Q99PL6 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ubxn6Q99PL6 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ubxn6Q99PL6 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ubxn6Q99PL6 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Ubxn6Q99PL6 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ubxn6Q99PL6 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ubxn6Q99PL6 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ubxn6Q99PL6 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ubxn6Q99PL6 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ubxn6Q99PL6 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ubxn6Q99PL6 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ubxn6Q99PL6 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ubxn6Q99PL6 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ubxn6Q99PL6 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ubxn6Q99PL6 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ubxn6Q99PL6 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ubxn6Q99PL6 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ubxn6Q99PL6 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ubxn6Q99PL6 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ubxn6Q99PL6 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ubxn6Q99PL6 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ubxn6Q99PL6 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ubxn6Q99PL6 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ubxn6Q99PL6 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ubxn6Q99PL6 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ubxn6Q99PL6 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ubxn6Q99PL6 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ubxn6Q99PL6 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ubxn6Q99PL6 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ubxn6Q99PL6 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ubxn6Q99PL6 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ubxn6Q99PL6 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ubxn6Q99PL6 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ubxn6Q99PL6 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ubxn6Q99PL6 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ubxn6Q99PL6 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ubxn6Q99PL6 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ubxn6Q99PL6 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ubxn6Q99PL6 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ubxn6Q99PL6 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ubxn6Q99PL6 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ubxn6Q99PL6 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ubxn6Q99PL6 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Ubxn6Q99PL6 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Ubxn6Q99PL6 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Ubxn6Q99PL6 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ubxn6Q99PL6 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ubxn6Q99PL6 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ubxn6Q99PL6 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ubxn6Q99PL6 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ubxn6Q99PL6 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ubxn6Q99PL6 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ubxn6Q99PL6 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ubxn6Q99PL6 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ubxn6Q99PL6 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ubxn6Q99PL6 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ubxn6Q99PL6 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ubxn6Q99PL6 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Ubxn6Q99PL6 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ubxn6Q99PL6 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.8 ms