Protein–RNA interactions for Protein: Q99PL5

Rrbp1, Ribosome-binding protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,605 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrbp1Q99PL5 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rrbp1Q99PL5 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Rrbp1Q99PL5 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Rrbp1Q99PL5 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rrbp1Q99PL5 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rrbp1Q99PL5 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rrbp1Q99PL5 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rrbp1Q99PL5 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Rrbp1Q99PL5 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rrbp1Q99PL5 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Rrbp1Q99PL5 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rrbp1Q99PL5 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rrbp1Q99PL5 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rrbp1Q99PL5 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rrbp1Q99PL5 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rrbp1Q99PL5 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rrbp1Q99PL5 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rrbp1Q99PL5 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Rrbp1Q99PL5 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rrbp1Q99PL5 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rrbp1Q99PL5 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rrbp1Q99PL5 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rrbp1Q99PL5 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rrbp1Q99PL5 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rrbp1Q99PL5 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rrbp1Q99PL5 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rrbp1Q99PL5 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rrbp1Q99PL5 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rrbp1Q99PL5 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rrbp1Q99PL5 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rrbp1Q99PL5 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rrbp1Q99PL5 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Rrbp1Q99PL5 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rrbp1Q99PL5 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rrbp1Q99PL5 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rrbp1Q99PL5 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Rrbp1Q99PL5 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rrbp1Q99PL5 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rrbp1Q99PL5 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rrbp1Q99PL5 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rrbp1Q99PL5 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rrbp1Q99PL5 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rrbp1Q99PL5 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rrbp1Q99PL5 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rrbp1Q99PL5 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rrbp1Q99PL5 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rrbp1Q99PL5 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Rrbp1Q99PL5 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rrbp1Q99PL5 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rrbp1Q99PL5 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rrbp1Q99PL5 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rrbp1Q99PL5 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rrbp1Q99PL5 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rrbp1Q99PL5 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rrbp1Q99PL5 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rrbp1Q99PL5 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rrbp1Q99PL5 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rrbp1Q99PL5 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rrbp1Q99PL5 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rrbp1Q99PL5 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rrbp1Q99PL5 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rrbp1Q99PL5 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Rrbp1Q99PL5 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rrbp1Q99PL5 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rrbp1Q99PL5 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rrbp1Q99PL5 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Rrbp1Q99PL5 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Rrbp1Q99PL5 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rrbp1Q99PL5 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Rrbp1Q99PL5 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Rrbp1Q99PL5 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rrbp1Q99PL5 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Rrbp1Q99PL5 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rrbp1Q99PL5 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rrbp1Q99PL5 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rrbp1Q99PL5 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rrbp1Q99PL5 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rrbp1Q99PL5 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rrbp1Q99PL5 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rrbp1Q99PL5 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rrbp1Q99PL5 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rrbp1Q99PL5 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rrbp1Q99PL5 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Rrbp1Q99PL5 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rrbp1Q99PL5 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Rrbp1Q99PL5 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rrbp1Q99PL5 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rrbp1Q99PL5 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rrbp1Q99PL5 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Rrbp1Q99PL5 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rrbp1Q99PL5 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rrbp1Q99PL5 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rrbp1Q99PL5 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rrbp1Q99PL5 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rrbp1Q99PL5 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rrbp1Q99PL5 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Rrbp1Q99PL5 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Rrbp1Q99PL5 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rrbp1Q99PL5 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rrbp1Q99PL5 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.6 ms