Protein–RNA interactions for Protein: Q99P51

Rassf3, Ras association domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rassf3Q99P51 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rassf3Q99P51 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rassf3Q99P51 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rassf3Q99P51 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rassf3Q99P51 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rassf3Q99P51 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rassf3Q99P51 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rassf3Q99P51 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rassf3Q99P51 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rassf3Q99P51 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rassf3Q99P51 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rassf3Q99P51 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rassf3Q99P51 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rassf3Q99P51 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Rassf3Q99P51 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rassf3Q99P51 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rassf3Q99P51 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rassf3Q99P51 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rassf3Q99P51 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rassf3Q99P51 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rassf3Q99P51 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rassf3Q99P51 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rassf3Q99P51 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rassf3Q99P51 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rassf3Q99P51 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Rassf3Q99P51 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rassf3Q99P51 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Rassf3Q99P51 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rassf3Q99P51 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rassf3Q99P51 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rassf3Q99P51 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Rassf3Q99P51 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rassf3Q99P51 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rassf3Q99P51 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rassf3Q99P51 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Rassf3Q99P51 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rassf3Q99P51 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rassf3Q99P51 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rassf3Q99P51 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rassf3Q99P51 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Rassf3Q99P51 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rassf3Q99P51 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rassf3Q99P51 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rassf3Q99P51 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Rassf3Q99P51 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Rassf3Q99P51 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rassf3Q99P51 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rassf3Q99P51 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rassf3Q99P51 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rassf3Q99P51 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rassf3Q99P51 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Rassf3Q99P51 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rassf3Q99P51 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rassf3Q99P51 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rassf3Q99P51 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rassf3Q99P51 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rassf3Q99P51 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rassf3Q99P51 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rassf3Q99P51 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rassf3Q99P51 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Rassf3Q99P51 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rassf3Q99P51 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Rassf3Q99P51 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Rassf3Q99P51 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Rassf3Q99P51 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rassf3Q99P51 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Rassf3Q99P51 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rassf3Q99P51 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rassf3Q99P51 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rassf3Q99P51 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rassf3Q99P51 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rassf3Q99P51 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rassf3Q99P51 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rassf3Q99P51 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rassf3Q99P51 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rassf3Q99P51 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rassf3Q99P51 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rassf3Q99P51 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rassf3Q99P51 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rassf3Q99P51 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rassf3Q99P51 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rassf3Q99P51 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rassf3Q99P51 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rassf3Q99P51 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rassf3Q99P51 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rassf3Q99P51 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rassf3Q99P51 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rassf3Q99P51 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rassf3Q99P51 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Rassf3Q99P51 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rassf3Q99P51 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rassf3Q99P51 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Rassf3Q99P51 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rassf3Q99P51 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rassf3Q99P51 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rassf3Q99P51 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rassf3Q99P51 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rassf3Q99P51 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rassf3Q99P51 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rassf3Q99P51 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms