Protein–RNA interactions for Protein: Q99NE5

Rims1, Regulating synaptic membrane exocytosis protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rims1Q99NE5 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rims1Q99NE5 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rims1Q99NE5 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rims1Q99NE5 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rims1Q99NE5 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rims1Q99NE5 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rims1Q99NE5 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rims1Q99NE5 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rims1Q99NE5 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rims1Q99NE5 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Rims1Q99NE5 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Rims1Q99NE5 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Rims1Q99NE5 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Rims1Q99NE5 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Rims1Q99NE5 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rims1Q99NE5 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rims1Q99NE5 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rims1Q99NE5 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rims1Q99NE5 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rims1Q99NE5 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rims1Q99NE5 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rims1Q99NE5 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Rims1Q99NE5 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rims1Q99NE5 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rims1Q99NE5 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rims1Q99NE5 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rims1Q99NE5 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Rims1Q99NE5 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Rims1Q99NE5 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Rims1Q99NE5 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Rims1Q99NE5 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Rims1Q99NE5 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rims1Q99NE5 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rims1Q99NE5 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Rims1Q99NE5 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rims1Q99NE5 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rims1Q99NE5 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Rims1Q99NE5 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rims1Q99NE5 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rims1Q99NE5 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Rims1Q99NE5 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Rims1Q99NE5 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Rims1Q99NE5 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rims1Q99NE5 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Rims1Q99NE5 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rims1Q99NE5 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Rims1Q99NE5 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Rims1Q99NE5 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Rims1Q99NE5 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Rims1Q99NE5 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Rims1Q99NE5 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Rims1Q99NE5 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Rims1Q99NE5 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Rims1Q99NE5 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Rims1Q99NE5 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rims1Q99NE5 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Rims1Q99NE5 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Rims1Q99NE5 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Rims1Q99NE5 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Rims1Q99NE5 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rims1Q99NE5 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rims1Q99NE5 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rims1Q99NE5 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rims1Q99NE5 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rims1Q99NE5 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rims1Q99NE5 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rims1Q99NE5 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Rims1Q99NE5 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rims1Q99NE5 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rims1Q99NE5 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rims1Q99NE5 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rims1Q99NE5 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rims1Q99NE5 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rims1Q99NE5 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Rims1Q99NE5 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rims1Q99NE5 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rims1Q99NE5 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC21.29■■□□□ 1
Rims1Q99NE5 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rims1Q99NE5 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Rims1Q99NE5 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rims1Q99NE5 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Rims1Q99NE5 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rims1Q99NE5 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rims1Q99NE5 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Rims1Q99NE5 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rims1Q99NE5 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rims1Q99NE5 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rims1Q99NE5 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rims1Q99NE5 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rims1Q99NE5 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rims1Q99NE5 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Rims1Q99NE5 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rims1Q99NE5 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rims1Q99NE5 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rims1Q99NE5 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rims1Q99NE5 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rims1Q99NE5 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rims1Q99NE5 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rims1Q99NE5 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rims1Q99NE5 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms