Protein–RNA interactions for Protein: Q99NB9

Sf3b1, Splicing factor 3B subunit 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b1Q99NB9 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sf3b1Q99NB9 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sf3b1Q99NB9 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sf3b1Q99NB9 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sf3b1Q99NB9 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sf3b1Q99NB9 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sf3b1Q99NB9 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sf3b1Q99NB9 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sf3b1Q99NB9 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sf3b1Q99NB9 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sf3b1Q99NB9 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sf3b1Q99NB9 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sf3b1Q99NB9 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sf3b1Q99NB9 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sf3b1Q99NB9 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sf3b1Q99NB9 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sf3b1Q99NB9 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Sf3b1Q99NB9 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sf3b1Q99NB9 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Sf3b1Q99NB9 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Sf3b1Q99NB9 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sf3b1Q99NB9 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sf3b1Q99NB9 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sf3b1Q99NB9 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sf3b1Q99NB9 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sf3b1Q99NB9 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sf3b1Q99NB9 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sf3b1Q99NB9 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Sf3b1Q99NB9 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Sf3b1Q99NB9 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Sf3b1Q99NB9 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Sf3b1Q99NB9 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Sf3b1Q99NB9 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sf3b1Q99NB9 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sf3b1Q99NB9 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sf3b1Q99NB9 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sf3b1Q99NB9 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sf3b1Q99NB9 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sf3b1Q99NB9 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sf3b1Q99NB9 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sf3b1Q99NB9 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sf3b1Q99NB9 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sf3b1Q99NB9 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Sf3b1Q99NB9 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Sf3b1Q99NB9 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Sf3b1Q99NB9 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sf3b1Q99NB9 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sf3b1Q99NB9 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sf3b1Q99NB9 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sf3b1Q99NB9 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sf3b1Q99NB9 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sf3b1Q99NB9 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sf3b1Q99NB9 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sf3b1Q99NB9 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sf3b1Q99NB9 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sf3b1Q99NB9 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sf3b1Q99NB9 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sf3b1Q99NB9 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sf3b1Q99NB9 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sf3b1Q99NB9 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sf3b1Q99NB9 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sf3b1Q99NB9 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sf3b1Q99NB9 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sf3b1Q99NB9 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sf3b1Q99NB9 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sf3b1Q99NB9 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sf3b1Q99NB9 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sf3b1Q99NB9 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Sf3b1Q99NB9 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Sf3b1Q99NB9 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sf3b1Q99NB9 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sf3b1Q99NB9 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Sf3b1Q99NB9 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sf3b1Q99NB9 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sf3b1Q99NB9 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sf3b1Q99NB9 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sf3b1Q99NB9 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sf3b1Q99NB9 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sf3b1Q99NB9 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Sf3b1Q99NB9 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sf3b1Q99NB9 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sf3b1Q99NB9 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sf3b1Q99NB9 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sf3b1Q99NB9 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sf3b1Q99NB9 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sf3b1Q99NB9 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sf3b1Q99NB9 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sf3b1Q99NB9 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Sf3b1Q99NB9 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sf3b1Q99NB9 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sf3b1Q99NB9 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sf3b1Q99NB9 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sf3b1Q99NB9 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sf3b1Q99NB9 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Sf3b1Q99NB9 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sf3b1Q99NB9 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sf3b1Q99NB9 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sf3b1Q99NB9 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Sf3b1Q99NB9 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sf3b1Q99NB9 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms