Protein–RNA interactions for Protein: Q99NA9

Pcgf6, Polycomb group RING finger protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcgf6Q99NA9 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pcgf6Q99NA9 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pcgf6Q99NA9 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pcgf6Q99NA9 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pcgf6Q99NA9 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pcgf6Q99NA9 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pcgf6Q99NA9 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pcgf6Q99NA9 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pcgf6Q99NA9 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pcgf6Q99NA9 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pcgf6Q99NA9 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pcgf6Q99NA9 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pcgf6Q99NA9 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pcgf6Q99NA9 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pcgf6Q99NA9 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pcgf6Q99NA9 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pcgf6Q99NA9 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pcgf6Q99NA9 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pcgf6Q99NA9 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pcgf6Q99NA9 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pcgf6Q99NA9 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Pcgf6Q99NA9 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pcgf6Q99NA9 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pcgf6Q99NA9 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pcgf6Q99NA9 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pcgf6Q99NA9 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pcgf6Q99NA9 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pcgf6Q99NA9 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Pcgf6Q99NA9 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pcgf6Q99NA9 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pcgf6Q99NA9 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pcgf6Q99NA9 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pcgf6Q99NA9 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pcgf6Q99NA9 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pcgf6Q99NA9 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pcgf6Q99NA9 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Pcgf6Q99NA9 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pcgf6Q99NA9 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pcgf6Q99NA9 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pcgf6Q99NA9 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pcgf6Q99NA9 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pcgf6Q99NA9 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pcgf6Q99NA9 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pcgf6Q99NA9 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pcgf6Q99NA9 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Pcgf6Q99NA9 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pcgf6Q99NA9 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pcgf6Q99NA9 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pcgf6Q99NA9 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pcgf6Q99NA9 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pcgf6Q99NA9 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pcgf6Q99NA9 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pcgf6Q99NA9 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pcgf6Q99NA9 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pcgf6Q99NA9 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pcgf6Q99NA9 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pcgf6Q99NA9 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pcgf6Q99NA9 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pcgf6Q99NA9 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pcgf6Q99NA9 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pcgf6Q99NA9 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pcgf6Q99NA9 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Pcgf6Q99NA9 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pcgf6Q99NA9 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pcgf6Q99NA9 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pcgf6Q99NA9 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pcgf6Q99NA9 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pcgf6Q99NA9 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pcgf6Q99NA9 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pcgf6Q99NA9 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pcgf6Q99NA9 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pcgf6Q99NA9 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pcgf6Q99NA9 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pcgf6Q99NA9 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pcgf6Q99NA9 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pcgf6Q99NA9 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pcgf6Q99NA9 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pcgf6Q99NA9 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Pcgf6Q99NA9 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pcgf6Q99NA9 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pcgf6Q99NA9 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pcgf6Q99NA9 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pcgf6Q99NA9 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pcgf6Q99NA9 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pcgf6Q99NA9 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pcgf6Q99NA9 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pcgf6Q99NA9 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pcgf6Q99NA9 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pcgf6Q99NA9 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Pcgf6Q99NA9 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Pcgf6Q99NA9 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Pcgf6Q99NA9 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Pcgf6Q99NA9 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Pcgf6Q99NA9 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Pcgf6Q99NA9 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Pcgf6Q99NA9 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Pcgf6Q99NA9 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Pcgf6Q99NA9 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Pcgf6Q99NA9 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Pcgf6Q99NA9 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms