Protein–RNA interactions for Protein: Q99N96

Mrpl1, 39S ribosomal protein L1, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl1Q99N96 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mrpl1Q99N96 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mrpl1Q99N96 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mrpl1Q99N96 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mrpl1Q99N96 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mrpl1Q99N96 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mrpl1Q99N96 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mrpl1Q99N96 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mrpl1Q99N96 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mrpl1Q99N96 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mrpl1Q99N96 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mrpl1Q99N96 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mrpl1Q99N96 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mrpl1Q99N96 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Mrpl1Q99N96 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mrpl1Q99N96 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mrpl1Q99N96 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Mrpl1Q99N96 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mrpl1Q99N96 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mrpl1Q99N96 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mrpl1Q99N96 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mrpl1Q99N96 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mrpl1Q99N96 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mrpl1Q99N96 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mrpl1Q99N96 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mrpl1Q99N96 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mrpl1Q99N96 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Mrpl1Q99N96 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mrpl1Q99N96 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mrpl1Q99N96 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mrpl1Q99N96 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mrpl1Q99N96 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mrpl1Q99N96 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mrpl1Q99N96 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mrpl1Q99N96 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mrpl1Q99N96 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mrpl1Q99N96 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Mrpl1Q99N96 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mrpl1Q99N96 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mrpl1Q99N96 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mrpl1Q99N96 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mrpl1Q99N96 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mrpl1Q99N96 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mrpl1Q99N96 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mrpl1Q99N96 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mrpl1Q99N96 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mrpl1Q99N96 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mrpl1Q99N96 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mrpl1Q99N96 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mrpl1Q99N96 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
Mrpl1Q99N96 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
Mrpl1Q99N96 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Mrpl1Q99N96 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mrpl1Q99N96 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mrpl1Q99N96 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mrpl1Q99N96 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mrpl1Q99N96 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mrpl1Q99N96 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mrpl1Q99N96 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mrpl1Q99N96 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mrpl1Q99N96 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mrpl1Q99N96 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Mrpl1Q99N96 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mrpl1Q99N96 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mrpl1Q99N96 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mrpl1Q99N96 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mrpl1Q99N96 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mrpl1Q99N96 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mrpl1Q99N96 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mrpl1Q99N96 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mrpl1Q99N96 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mrpl1Q99N96 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mrpl1Q99N96 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mrpl1Q99N96 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mrpl1Q99N96 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mrpl1Q99N96 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mrpl1Q99N96 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mrpl1Q99N96 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mrpl1Q99N96 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mrpl1Q99N96 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mrpl1Q99N96 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mrpl1Q99N96 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mrpl1Q99N96 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mrpl1Q99N96 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mrpl1Q99N96 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mrpl1Q99N96 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mrpl1Q99N96 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mrpl1Q99N96 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Mrpl1Q99N96 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Mrpl1Q99N96 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mrpl1Q99N96 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mrpl1Q99N96 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mrpl1Q99N96 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mrpl1Q99N96 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mrpl1Q99N96 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mrpl1Q99N96 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mrpl1Q99N96 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mrpl1Q99N96 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mrpl1Q99N96 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mrpl1Q99N96 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms