Protein–RNA interactions for Protein: Q99N13

Hdac9, Histone deacetylase 9, mousemouse

Predictions only

Length 588 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac9Q99N13 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Hdac9Q99N13 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Hdac9Q99N13 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Hdac9Q99N13 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Hdac9Q99N13 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Hdac9Q99N13 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Hdac9Q99N13 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Hdac9Q99N13 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Hdac9Q99N13 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Hdac9Q99N13 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Hdac9Q99N13 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Hdac9Q99N13 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Hdac9Q99N13 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Hdac9Q99N13 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Hdac9Q99N13 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Hdac9Q99N13 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Hdac9Q99N13 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Hdac9Q99N13 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Hdac9Q99N13 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Hdac9Q99N13 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Hdac9Q99N13 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Hdac9Q99N13 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Hdac9Q99N13 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Hdac9Q99N13 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Hdac9Q99N13 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Hdac9Q99N13 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Hdac9Q99N13 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Hdac9Q99N13 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hdac9Q99N13 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hdac9Q99N13 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hdac9Q99N13 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hdac9Q99N13 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hdac9Q99N13 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hdac9Q99N13 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hdac9Q99N13 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hdac9Q99N13 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hdac9Q99N13 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hdac9Q99N13 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hdac9Q99N13 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hdac9Q99N13 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hdac9Q99N13 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hdac9Q99N13 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hdac9Q99N13 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hdac9Q99N13 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Hdac9Q99N13 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hdac9Q99N13 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hdac9Q99N13 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hdac9Q99N13 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hdac9Q99N13 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hdac9Q99N13 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Hdac9Q99N13 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Hdac9Q99N13 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Hdac9Q99N13 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Hdac9Q99N13 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Hdac9Q99N13 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Hdac9Q99N13 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Hdac9Q99N13 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Hdac9Q99N13 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Hdac9Q99N13 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Hdac9Q99N13 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Hdac9Q99N13 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Hdac9Q99N13 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Hdac9Q99N13 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Hdac9Q99N13 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Hdac9Q99N13 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Hdac9Q99N13 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Hdac9Q99N13 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Hdac9Q99N13 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Hdac9Q99N13 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Hdac9Q99N13 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Hdac9Q99N13 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Hdac9Q99N13 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Hdac9Q99N13 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Hdac9Q99N13 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Hdac9Q99N13 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Hdac9Q99N13 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Hdac9Q99N13 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Hdac9Q99N13 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Hdac9Q99N13 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Hdac9Q99N13 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Hdac9Q99N13 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Hdac9Q99N13 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Hdac9Q99N13 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
Hdac9Q99N13 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Hdac9Q99N13 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Hdac9Q99N13 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Hdac9Q99N13 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Hdac9Q99N13 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Hdac9Q99N13 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Hdac9Q99N13 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Hdac9Q99N13 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Hdac9Q99N13 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Hdac9Q99N13 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Hdac9Q99N13 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hdac9Q99N13 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Hdac9Q99N13 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hdac9Q99N13 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hdac9Q99N13 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hdac9Q99N13 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hdac9Q99N13 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms