Protein–RNA interactions for Protein: Q99MW3

Pramel1, Preferentially expressed antigen in melanoma-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramel1Q99MW3 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pramel1Q99MW3 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pramel1Q99MW3 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pramel1Q99MW3 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pramel1Q99MW3 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pramel1Q99MW3 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pramel1Q99MW3 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pramel1Q99MW3 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Pramel1Q99MW3 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pramel1Q99MW3 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pramel1Q99MW3 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pramel1Q99MW3 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pramel1Q99MW3 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pramel1Q99MW3 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pramel1Q99MW3 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pramel1Q99MW3 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pramel1Q99MW3 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pramel1Q99MW3 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Pramel1Q99MW3 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Pramel1Q99MW3 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pramel1Q99MW3 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pramel1Q99MW3 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pramel1Q99MW3 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pramel1Q99MW3 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pramel1Q99MW3 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pramel1Q99MW3 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pramel1Q99MW3 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pramel1Q99MW3 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pramel1Q99MW3 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pramel1Q99MW3 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Pramel1Q99MW3 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pramel1Q99MW3 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pramel1Q99MW3 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pramel1Q99MW3 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pramel1Q99MW3 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pramel1Q99MW3 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pramel1Q99MW3 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pramel1Q99MW3 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pramel1Q99MW3 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pramel1Q99MW3 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pramel1Q99MW3 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pramel1Q99MW3 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pramel1Q99MW3 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pramel1Q99MW3 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pramel1Q99MW3 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pramel1Q99MW3 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Pramel1Q99MW3 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pramel1Q99MW3 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pramel1Q99MW3 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Pramel1Q99MW3 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Pramel1Q99MW3 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pramel1Q99MW3 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pramel1Q99MW3 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pramel1Q99MW3 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pramel1Q99MW3 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pramel1Q99MW3 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pramel1Q99MW3 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pramel1Q99MW3 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pramel1Q99MW3 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pramel1Q99MW3 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pramel1Q99MW3 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pramel1Q99MW3 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pramel1Q99MW3 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pramel1Q99MW3 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Pramel1Q99MW3 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pramel1Q99MW3 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pramel1Q99MW3 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pramel1Q99MW3 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pramel1Q99MW3 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pramel1Q99MW3 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pramel1Q99MW3 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pramel1Q99MW3 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pramel1Q99MW3 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pramel1Q99MW3 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pramel1Q99MW3 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pramel1Q99MW3 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pramel1Q99MW3 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pramel1Q99MW3 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pramel1Q99MW3 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pramel1Q99MW3 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pramel1Q99MW3 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Pramel1Q99MW3 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pramel1Q99MW3 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pramel1Q99MW3 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pramel1Q99MW3 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pramel1Q99MW3 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pramel1Q99MW3 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pramel1Q99MW3 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Pramel1Q99MW3 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Pramel1Q99MW3 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pramel1Q99MW3 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Pramel1Q99MW3 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pramel1Q99MW3 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pramel1Q99MW3 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pramel1Q99MW3 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Pramel1Q99MW3 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pramel1Q99MW3 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pramel1Q99MW3 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pramel1Q99MW3 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pramel1Q99MW3 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms