Protein–RNA interactions for Protein: Q99MV7

Rnf17, RING finger protein 17, mousemouse

Predictions only

Length 1,640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf17Q99MV7 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rnf17Q99MV7 Mir6420-201ENSMUST00000185032 102 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Rnf17Q99MV7 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Rnf17Q99MV7 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rnf17Q99MV7 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rnf17Q99MV7 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rnf17Q99MV7 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rnf17Q99MV7 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rnf17Q99MV7 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rnf17Q99MV7 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rnf17Q99MV7 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rnf17Q99MV7 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rnf17Q99MV7 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Rnf17Q99MV7 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Rnf17Q99MV7 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rnf17Q99MV7 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rnf17Q99MV7 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Rnf17Q99MV7 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Rnf17Q99MV7 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rnf17Q99MV7 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rnf17Q99MV7 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rnf17Q99MV7 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rnf17Q99MV7 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rnf17Q99MV7 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rnf17Q99MV7 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rnf17Q99MV7 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rnf17Q99MV7 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rnf17Q99MV7 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rnf17Q99MV7 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rnf17Q99MV7 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Rnf17Q99MV7 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rnf17Q99MV7 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rnf17Q99MV7 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rnf17Q99MV7 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rnf17Q99MV7 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rnf17Q99MV7 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rnf17Q99MV7 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rnf17Q99MV7 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Rnf17Q99MV7 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rnf17Q99MV7 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rnf17Q99MV7 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rnf17Q99MV7 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rnf17Q99MV7 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rnf17Q99MV7 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rnf17Q99MV7 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Rnf17Q99MV7 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rnf17Q99MV7 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rnf17Q99MV7 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rnf17Q99MV7 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rnf17Q99MV7 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Rnf17Q99MV7 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rnf17Q99MV7 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rnf17Q99MV7 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rnf17Q99MV7 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rnf17Q99MV7 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rnf17Q99MV7 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rnf17Q99MV7 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rnf17Q99MV7 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rnf17Q99MV7 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rnf17Q99MV7 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rnf17Q99MV7 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Rnf17Q99MV7 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rnf17Q99MV7 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rnf17Q99MV7 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Rnf17Q99MV7 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rnf17Q99MV7 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rnf17Q99MV7 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rnf17Q99MV7 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rnf17Q99MV7 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rnf17Q99MV7 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rnf17Q99MV7 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rnf17Q99MV7 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rnf17Q99MV7 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rnf17Q99MV7 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rnf17Q99MV7 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Rnf17Q99MV7 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rnf17Q99MV7 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rnf17Q99MV7 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rnf17Q99MV7 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rnf17Q99MV7 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rnf17Q99MV7 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rnf17Q99MV7 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rnf17Q99MV7 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rnf17Q99MV7 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rnf17Q99MV7 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Rnf17Q99MV7 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Rnf17Q99MV7 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rnf17Q99MV7 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rnf17Q99MV7 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rnf17Q99MV7 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Rnf17Q99MV7 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Rnf17Q99MV7 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rnf17Q99MV7 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rnf17Q99MV7 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rnf17Q99MV7 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rnf17Q99MV7 Gas5-210ENSMUST00000159706 557 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rnf17Q99MV7 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Rnf17Q99MV7 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rnf17Q99MV7 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Rnf17Q99MV7 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.9 ms