Protein–RNA interactions for Protein: Q99ME3

Sncaip, Synphilin-1, mousemouse

Predictions only

Length 962 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SncaipQ99ME3 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SncaipQ99ME3 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SncaipQ99ME3 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SncaipQ99ME3 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SncaipQ99ME3 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SncaipQ99ME3 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SncaipQ99ME3 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SncaipQ99ME3 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SncaipQ99ME3 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SncaipQ99ME3 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SncaipQ99ME3 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SncaipQ99ME3 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SncaipQ99ME3 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SncaipQ99ME3 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SncaipQ99ME3 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SncaipQ99ME3 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SncaipQ99ME3 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SncaipQ99ME3 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SncaipQ99ME3 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SncaipQ99ME3 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SncaipQ99ME3 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SncaipQ99ME3 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SncaipQ99ME3 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SncaipQ99ME3 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SncaipQ99ME3 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SncaipQ99ME3 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SncaipQ99ME3 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SncaipQ99ME3 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SncaipQ99ME3 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SncaipQ99ME3 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SncaipQ99ME3 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SncaipQ99ME3 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SncaipQ99ME3 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SncaipQ99ME3 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SncaipQ99ME3 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SncaipQ99ME3 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SncaipQ99ME3 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SncaipQ99ME3 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SncaipQ99ME3 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SncaipQ99ME3 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SncaipQ99ME3 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SncaipQ99ME3 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
SncaipQ99ME3 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SncaipQ99ME3 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SncaipQ99ME3 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SncaipQ99ME3 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SncaipQ99ME3 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SncaipQ99ME3 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SncaipQ99ME3 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
SncaipQ99ME3 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SncaipQ99ME3 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SncaipQ99ME3 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SncaipQ99ME3 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SncaipQ99ME3 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SncaipQ99ME3 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SncaipQ99ME3 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SncaipQ99ME3 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SncaipQ99ME3 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SncaipQ99ME3 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SncaipQ99ME3 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SncaipQ99ME3 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SncaipQ99ME3 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SncaipQ99ME3 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
SncaipQ99ME3 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SncaipQ99ME3 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SncaipQ99ME3 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SncaipQ99ME3 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SncaipQ99ME3 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SncaipQ99ME3 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SncaipQ99ME3 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SncaipQ99ME3 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SncaipQ99ME3 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SncaipQ99ME3 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SncaipQ99ME3 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SncaipQ99ME3 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
SncaipQ99ME3 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
SncaipQ99ME3 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
SncaipQ99ME3 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SncaipQ99ME3 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SncaipQ99ME3 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SncaipQ99ME3 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SncaipQ99ME3 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SncaipQ99ME3 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SncaipQ99ME3 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SncaipQ99ME3 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SncaipQ99ME3 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SncaipQ99ME3 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SncaipQ99ME3 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SncaipQ99ME3 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SncaipQ99ME3 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SncaipQ99ME3 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SncaipQ99ME3 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SncaipQ99ME3 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SncaipQ99ME3 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SncaipQ99ME3 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SncaipQ99ME3 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SncaipQ99ME3 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SncaipQ99ME3 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SncaipQ99ME3 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SncaipQ99ME3 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms