Protein–RNA interactions for Protein: Q99M08

Uncharacterized protein C4orf3 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 65 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q99M08 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Q99M08 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Q99M08 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Q99M08 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Q99M08 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Q99M08 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Q99M08 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Q99M08 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Q99M08 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Q99M08 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Q99M08 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Q99M08 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Q99M08 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Q99M08 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Q99M08 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Q99M08 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Q99M08 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Q99M08 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Q99M08 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Q99M08 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Q99M08 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Q99M08 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Q99M08 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Q99M08 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Q99M08 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Q99M08 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Q99M08 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Q99M08 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Q99M08 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Q99M08 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Q99M08 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Q99M08 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Q99M08 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Q99M08 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Q99M08 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Q99M08 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Q99M08 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Q99M08 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Q99M08 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Q99M08 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Q99M08 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Q99M08 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Q99M08 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Q99M08 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Q99M08 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Q99M08 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Q99M08 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Q99M08 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Q99M08 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Q99M08 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Q99M08 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Q99M08 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Q99M08 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Q99M08 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Q99M08 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Q99M08 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Q99M08 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Q99M08 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Q99M08 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Q99M08 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Q99M08 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Q99M08 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Q99M08 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Q99M08 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Q99M08 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Q99M08 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Q99M08 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Q99M08 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Q99M08 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Q99M08 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Q99M08 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Q99M08 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Q99M08 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Q99M08 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Q99M08 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Q99M08 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Q99M08 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Q99M08 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Q99M08 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Q99M08 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Q99M08 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Q99M08 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Q99M08 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Q99M08 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Q99M08 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Q99M08 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Q99M08 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Q99M08 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Q99M08 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Q99M08 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Q99M08 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Q99M08 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Q99M08 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Q99M08 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Q99M08 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Q99M08 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Q99M08 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Q99M08 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Q99M08 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Q99M08 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.8 ms