Protein–RNA interactions for Protein: Q99LZ3

Gins4, DNA replication complex GINS protein SLD5, mousemouse

Predictions only

Length 223 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gins4Q99LZ3 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gins4Q99LZ3 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gins4Q99LZ3 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gins4Q99LZ3 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gins4Q99LZ3 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gins4Q99LZ3 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gins4Q99LZ3 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gins4Q99LZ3 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gins4Q99LZ3 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Gins4Q99LZ3 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Gins4Q99LZ3 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Gins4Q99LZ3 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Gins4Q99LZ3 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Gins4Q99LZ3 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Gins4Q99LZ3 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Gins4Q99LZ3 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gins4Q99LZ3 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gins4Q99LZ3 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gins4Q99LZ3 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gins4Q99LZ3 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gins4Q99LZ3 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Gins4Q99LZ3 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gins4Q99LZ3 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Gins4Q99LZ3 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gins4Q99LZ3 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gins4Q99LZ3 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gins4Q99LZ3 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gins4Q99LZ3 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gins4Q99LZ3 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gins4Q99LZ3 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gins4Q99LZ3 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gins4Q99LZ3 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gins4Q99LZ3 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gins4Q99LZ3 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gins4Q99LZ3 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gins4Q99LZ3 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gins4Q99LZ3 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gins4Q99LZ3 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gins4Q99LZ3 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gins4Q99LZ3 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gins4Q99LZ3 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gins4Q99LZ3 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gins4Q99LZ3 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gins4Q99LZ3 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gins4Q99LZ3 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gins4Q99LZ3 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Gins4Q99LZ3 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gins4Q99LZ3 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gins4Q99LZ3 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gins4Q99LZ3 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gins4Q99LZ3 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gins4Q99LZ3 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gins4Q99LZ3 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gins4Q99LZ3 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gins4Q99LZ3 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gins4Q99LZ3 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gins4Q99LZ3 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gins4Q99LZ3 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gins4Q99LZ3 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gins4Q99LZ3 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gins4Q99LZ3 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gins4Q99LZ3 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gins4Q99LZ3 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gins4Q99LZ3 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gins4Q99LZ3 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gins4Q99LZ3 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gins4Q99LZ3 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gins4Q99LZ3 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gins4Q99LZ3 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gins4Q99LZ3 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gins4Q99LZ3 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gins4Q99LZ3 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gins4Q99LZ3 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Gins4Q99LZ3 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gins4Q99LZ3 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gins4Q99LZ3 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gins4Q99LZ3 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gins4Q99LZ3 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gins4Q99LZ3 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gins4Q99LZ3 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gins4Q99LZ3 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gins4Q99LZ3 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gins4Q99LZ3 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gins4Q99LZ3 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gins4Q99LZ3 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gins4Q99LZ3 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gins4Q99LZ3 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gins4Q99LZ3 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gins4Q99LZ3 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gins4Q99LZ3 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gins4Q99LZ3 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gins4Q99LZ3 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gins4Q99LZ3 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gins4Q99LZ3 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gins4Q99LZ3 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gins4Q99LZ3 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gins4Q99LZ3 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Gins4Q99LZ3 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gins4Q99LZ3 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gins4Q99LZ3 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
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