Protein–RNA interactions for Protein: Q99LG0

Usp16, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 16, mousemouse

Predictions only

Length 825 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp16Q99LG0 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Usp16Q99LG0 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Usp16Q99LG0 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Usp16Q99LG0 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Usp16Q99LG0 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Usp16Q99LG0 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Usp16Q99LG0 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Usp16Q99LG0 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Usp16Q99LG0 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Usp16Q99LG0 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Usp16Q99LG0 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Usp16Q99LG0 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Usp16Q99LG0 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Usp16Q99LG0 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Usp16Q99LG0 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Usp16Q99LG0 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Usp16Q99LG0 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Usp16Q99LG0 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Usp16Q99LG0 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Usp16Q99LG0 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Usp16Q99LG0 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Usp16Q99LG0 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Usp16Q99LG0 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Usp16Q99LG0 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Usp16Q99LG0 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Usp16Q99LG0 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Usp16Q99LG0 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Usp16Q99LG0 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Usp16Q99LG0 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Usp16Q99LG0 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Usp16Q99LG0 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Usp16Q99LG0 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Usp16Q99LG0 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Usp16Q99LG0 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Usp16Q99LG0 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Usp16Q99LG0 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Usp16Q99LG0 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Usp16Q99LG0 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Usp16Q99LG0 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Usp16Q99LG0 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Usp16Q99LG0 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Usp16Q99LG0 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Usp16Q99LG0 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Usp16Q99LG0 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Usp16Q99LG0 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Usp16Q99LG0 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Usp16Q99LG0 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Usp16Q99LG0 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Usp16Q99LG0 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Usp16Q99LG0 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Usp16Q99LG0 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Usp16Q99LG0 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Usp16Q99LG0 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Usp16Q99LG0 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Usp16Q99LG0 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Usp16Q99LG0 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Usp16Q99LG0 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Usp16Q99LG0 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Usp16Q99LG0 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Usp16Q99LG0 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Usp16Q99LG0 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Usp16Q99LG0 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Usp16Q99LG0 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Usp16Q99LG0 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Usp16Q99LG0 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Usp16Q99LG0 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Usp16Q99LG0 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Usp16Q99LG0 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Usp16Q99LG0 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Usp16Q99LG0 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Usp16Q99LG0 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Usp16Q99LG0 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Usp16Q99LG0 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Usp16Q99LG0 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Usp16Q99LG0 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Usp16Q99LG0 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Usp16Q99LG0 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Usp16Q99LG0 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Usp16Q99LG0 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Usp16Q99LG0 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Usp16Q99LG0 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Usp16Q99LG0 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Usp16Q99LG0 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Usp16Q99LG0 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Usp16Q99LG0 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Usp16Q99LG0 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Usp16Q99LG0 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Usp16Q99LG0 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Usp16Q99LG0 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Usp16Q99LG0 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Usp16Q99LG0 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Usp16Q99LG0 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Usp16Q99LG0 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Usp16Q99LG0 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Usp16Q99LG0 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Usp16Q99LG0 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Usp16Q99LG0 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Usp16Q99LG0 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Usp16Q99LG0 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Usp16Q99LG0 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.8 ms