Protein–RNA interactions for Protein: Q99LE6

Abcf2, ATP-binding cassette sub-family F member 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 628 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcf2Q99LE6 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Abcf2Q99LE6 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Abcf2Q99LE6 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Abcf2Q99LE6 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Abcf2Q99LE6 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Abcf2Q99LE6 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Abcf2Q99LE6 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Abcf2Q99LE6 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Abcf2Q99LE6 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Abcf2Q99LE6 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Abcf2Q99LE6 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Abcf2Q99LE6 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Abcf2Q99LE6 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Abcf2Q99LE6 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Abcf2Q99LE6 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Abcf2Q99LE6 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Abcf2Q99LE6 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Abcf2Q99LE6 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Abcf2Q99LE6 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Abcf2Q99LE6 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Abcf2Q99LE6 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Abcf2Q99LE6 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Abcf2Q99LE6 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Abcf2Q99LE6 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Abcf2Q99LE6 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Abcf2Q99LE6 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Abcf2Q99LE6 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Abcf2Q99LE6 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Abcf2Q99LE6 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Abcf2Q99LE6 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Abcf2Q99LE6 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Abcf2Q99LE6 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Abcf2Q99LE6 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Abcf2Q99LE6 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Abcf2Q99LE6 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Abcf2Q99LE6 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Abcf2Q99LE6 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Abcf2Q99LE6 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Abcf2Q99LE6 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Abcf2Q99LE6 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Abcf2Q99LE6 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Abcf2Q99LE6 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Abcf2Q99LE6 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Abcf2Q99LE6 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Abcf2Q99LE6 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Abcf2Q99LE6 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Abcf2Q99LE6 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Abcf2Q99LE6 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Abcf2Q99LE6 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Abcf2Q99LE6 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Abcf2Q99LE6 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Abcf2Q99LE6 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Abcf2Q99LE6 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Abcf2Q99LE6 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Abcf2Q99LE6 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Abcf2Q99LE6 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Abcf2Q99LE6 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Abcf2Q99LE6 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Abcf2Q99LE6 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Abcf2Q99LE6 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Abcf2Q99LE6 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Abcf2Q99LE6 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Abcf2Q99LE6 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Abcf2Q99LE6 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Abcf2Q99LE6 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Abcf2Q99LE6 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Abcf2Q99LE6 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Abcf2Q99LE6 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Abcf2Q99LE6 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Abcf2Q99LE6 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Abcf2Q99LE6 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Abcf2Q99LE6 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Abcf2Q99LE6 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Abcf2Q99LE6 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Abcf2Q99LE6 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Abcf2Q99LE6 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Abcf2Q99LE6 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Abcf2Q99LE6 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Abcf2Q99LE6 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Abcf2Q99LE6 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Abcf2Q99LE6 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Abcf2Q99LE6 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Abcf2Q99LE6 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Abcf2Q99LE6 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Abcf2Q99LE6 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Abcf2Q99LE6 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Abcf2Q99LE6 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Abcf2Q99LE6 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Abcf2Q99LE6 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Abcf2Q99LE6 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Abcf2Q99LE6 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Abcf2Q99LE6 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Abcf2Q99LE6 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Abcf2Q99LE6 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Abcf2Q99LE6 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Abcf2Q99LE6 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Abcf2Q99LE6 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Abcf2Q99LE6 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Abcf2Q99LE6 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Abcf2Q99LE6 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms