Protein–RNA interactions for Protein: Q99L02

Pagr1a, PAXIP1-associated glutamate-rich protein 1A, mousemouse

Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pagr1aQ99L02 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pagr1aQ99L02 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pagr1aQ99L02 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Pagr1aQ99L02 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Pagr1aQ99L02 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Pagr1aQ99L02 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pagr1aQ99L02 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Pagr1aQ99L02 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pagr1aQ99L02 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pagr1aQ99L02 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pagr1aQ99L02 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pagr1aQ99L02 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pagr1aQ99L02 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Pagr1aQ99L02 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pagr1aQ99L02 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pagr1aQ99L02 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pagr1aQ99L02 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pagr1aQ99L02 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pagr1aQ99L02 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pagr1aQ99L02 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pagr1aQ99L02 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pagr1aQ99L02 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pagr1aQ99L02 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Pagr1aQ99L02 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pagr1aQ99L02 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pagr1aQ99L02 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pagr1aQ99L02 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pagr1aQ99L02 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pagr1aQ99L02 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pagr1aQ99L02 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pagr1aQ99L02 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pagr1aQ99L02 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pagr1aQ99L02 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pagr1aQ99L02 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Pagr1aQ99L02 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Pagr1aQ99L02 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Pagr1aQ99L02 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Pagr1aQ99L02 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Pagr1aQ99L02 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Pagr1aQ99L02 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Pagr1aQ99L02 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pagr1aQ99L02 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pagr1aQ99L02 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pagr1aQ99L02 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pagr1aQ99L02 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pagr1aQ99L02 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pagr1aQ99L02 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pagr1aQ99L02 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pagr1aQ99L02 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pagr1aQ99L02 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pagr1aQ99L02 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pagr1aQ99L02 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pagr1aQ99L02 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Pagr1aQ99L02 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pagr1aQ99L02 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pagr1aQ99L02 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pagr1aQ99L02 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Pagr1aQ99L02 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pagr1aQ99L02 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pagr1aQ99L02 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pagr1aQ99L02 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pagr1aQ99L02 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pagr1aQ99L02 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pagr1aQ99L02 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pagr1aQ99L02 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pagr1aQ99L02 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pagr1aQ99L02 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pagr1aQ99L02 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pagr1aQ99L02 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pagr1aQ99L02 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pagr1aQ99L02 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pagr1aQ99L02 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pagr1aQ99L02 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pagr1aQ99L02 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pagr1aQ99L02 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Pagr1aQ99L02 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Pagr1aQ99L02 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pagr1aQ99L02 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pagr1aQ99L02 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Pagr1aQ99L02 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pagr1aQ99L02 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pagr1aQ99L02 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pagr1aQ99L02 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pagr1aQ99L02 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Pagr1aQ99L02 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pagr1aQ99L02 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pagr1aQ99L02 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pagr1aQ99L02 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pagr1aQ99L02 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pagr1aQ99L02 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pagr1aQ99L02 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pagr1aQ99L02 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pagr1aQ99L02 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pagr1aQ99L02 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pagr1aQ99L02 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pagr1aQ99L02 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pagr1aQ99L02 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pagr1aQ99L02 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pagr1aQ99L02 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pagr1aQ99L02 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms