Protein–RNA interactions for Protein: Q99KW3

Triobp, TRIO and F-actin-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 2,014 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TriobpQ99KW3 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TriobpQ99KW3 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TriobpQ99KW3 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TriobpQ99KW3 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TriobpQ99KW3 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TriobpQ99KW3 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TriobpQ99KW3 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TriobpQ99KW3 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TriobpQ99KW3 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TriobpQ99KW3 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TriobpQ99KW3 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
TriobpQ99KW3 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
TriobpQ99KW3 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TriobpQ99KW3 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TriobpQ99KW3 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
TriobpQ99KW3 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TriobpQ99KW3 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TriobpQ99KW3 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TriobpQ99KW3 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TriobpQ99KW3 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TriobpQ99KW3 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TriobpQ99KW3 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TriobpQ99KW3 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TriobpQ99KW3 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TriobpQ99KW3 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TriobpQ99KW3 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TriobpQ99KW3 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TriobpQ99KW3 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TriobpQ99KW3 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TriobpQ99KW3 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TriobpQ99KW3 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TriobpQ99KW3 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TriobpQ99KW3 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TriobpQ99KW3 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
TriobpQ99KW3 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TriobpQ99KW3 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TriobpQ99KW3 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TriobpQ99KW3 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TriobpQ99KW3 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TriobpQ99KW3 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TriobpQ99KW3 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TriobpQ99KW3 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TriobpQ99KW3 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TriobpQ99KW3 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TriobpQ99KW3 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
TriobpQ99KW3 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TriobpQ99KW3 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TriobpQ99KW3 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TriobpQ99KW3 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
TriobpQ99KW3 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TriobpQ99KW3 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TriobpQ99KW3 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TriobpQ99KW3 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TriobpQ99KW3 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TriobpQ99KW3 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TriobpQ99KW3 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TriobpQ99KW3 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TriobpQ99KW3 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TriobpQ99KW3 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TriobpQ99KW3 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TriobpQ99KW3 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TriobpQ99KW3 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TriobpQ99KW3 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TriobpQ99KW3 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TriobpQ99KW3 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TriobpQ99KW3 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TriobpQ99KW3 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TriobpQ99KW3 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TriobpQ99KW3 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TriobpQ99KW3 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TriobpQ99KW3 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
TriobpQ99KW3 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TriobpQ99KW3 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TriobpQ99KW3 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TriobpQ99KW3 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TriobpQ99KW3 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TriobpQ99KW3 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TriobpQ99KW3 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TriobpQ99KW3 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TriobpQ99KW3 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
TriobpQ99KW3 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TriobpQ99KW3 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TriobpQ99KW3 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TriobpQ99KW3 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TriobpQ99KW3 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TriobpQ99KW3 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TriobpQ99KW3 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TriobpQ99KW3 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TriobpQ99KW3 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TriobpQ99KW3 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
TriobpQ99KW3 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TriobpQ99KW3 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TriobpQ99KW3 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TriobpQ99KW3 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TriobpQ99KW3 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TriobpQ99KW3 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TriobpQ99KW3 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
TriobpQ99KW3 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TriobpQ99KW3 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TriobpQ99KW3 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.3 ms