Protein–RNA interactions for Protein: Q99KP6

Prpf19, Pre-mRNA-processing factor 19, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf19Q99KP6 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Prpf19Q99KP6 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Prpf19Q99KP6 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Prpf19Q99KP6 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prpf19Q99KP6 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prpf19Q99KP6 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prpf19Q99KP6 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Prpf19Q99KP6 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prpf19Q99KP6 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prpf19Q99KP6 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prpf19Q99KP6 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Prpf19Q99KP6 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prpf19Q99KP6 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Prpf19Q99KP6 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Prpf19Q99KP6 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Prpf19Q99KP6 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prpf19Q99KP6 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Prpf19Q99KP6 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prpf19Q99KP6 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prpf19Q99KP6 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prpf19Q99KP6 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Prpf19Q99KP6 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Prpf19Q99KP6 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prpf19Q99KP6 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prpf19Q99KP6 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prpf19Q99KP6 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prpf19Q99KP6 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prpf19Q99KP6 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Prpf19Q99KP6 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prpf19Q99KP6 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prpf19Q99KP6 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prpf19Q99KP6 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Prpf19Q99KP6 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prpf19Q99KP6 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Prpf19Q99KP6 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Prpf19Q99KP6 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prpf19Q99KP6 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prpf19Q99KP6 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prpf19Q99KP6 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prpf19Q99KP6 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prpf19Q99KP6 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prpf19Q99KP6 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Prpf19Q99KP6 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Prpf19Q99KP6 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Prpf19Q99KP6 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prpf19Q99KP6 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Prpf19Q99KP6 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prpf19Q99KP6 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prpf19Q99KP6 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prpf19Q99KP6 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prpf19Q99KP6 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prpf19Q99KP6 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prpf19Q99KP6 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prpf19Q99KP6 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Prpf19Q99KP6 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prpf19Q99KP6 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Prpf19Q99KP6 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Prpf19Q99KP6 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Prpf19Q99KP6 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Prpf19Q99KP6 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Prpf19Q99KP6 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Prpf19Q99KP6 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Prpf19Q99KP6 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Prpf19Q99KP6 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Prpf19Q99KP6 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Prpf19Q99KP6 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Prpf19Q99KP6 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Prpf19Q99KP6 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Prpf19Q99KP6 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Prpf19Q99KP6 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Prpf19Q99KP6 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Prpf19Q99KP6 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Prpf19Q99KP6 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Prpf19Q99KP6 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Prpf19Q99KP6 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Prpf19Q99KP6 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Prpf19Q99KP6 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Prpf19Q99KP6 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Prpf19Q99KP6 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Prpf19Q99KP6 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Prpf19Q99KP6 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Prpf19Q99KP6 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Prpf19Q99KP6 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Prpf19Q99KP6 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Prpf19Q99KP6 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Prpf19Q99KP6 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Prpf19Q99KP6 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Prpf19Q99KP6 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Prpf19Q99KP6 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Prpf19Q99KP6 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Prpf19Q99KP6 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Prpf19Q99KP6 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Prpf19Q99KP6 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Prpf19Q99KP6 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Prpf19Q99KP6 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Prpf19Q99KP6 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Prpf19Q99KP6 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Prpf19Q99KP6 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Prpf19Q99KP6 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Prpf19Q99KP6 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms