Protein–RNA interactions for Protein: Q99KJ0

Ubxn2a, UBX domain-containing protein 2A, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn2aQ99KJ0 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ubxn2aQ99KJ0 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ubxn2aQ99KJ0 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ubxn2aQ99KJ0 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ubxn2aQ99KJ0 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ubxn2aQ99KJ0 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ubxn2aQ99KJ0 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ubxn2aQ99KJ0 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Ubxn2aQ99KJ0 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ubxn2aQ99KJ0 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ubxn2aQ99KJ0 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ubxn2aQ99KJ0 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ubxn2aQ99KJ0 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ubxn2aQ99KJ0 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ubxn2aQ99KJ0 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ubxn2aQ99KJ0 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ubxn2aQ99KJ0 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ubxn2aQ99KJ0 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ubxn2aQ99KJ0 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ubxn2aQ99KJ0 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ubxn2aQ99KJ0 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ubxn2aQ99KJ0 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ubxn2aQ99KJ0 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ubxn2aQ99KJ0 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ubxn2aQ99KJ0 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ubxn2aQ99KJ0 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Ubxn2aQ99KJ0 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ubxn2aQ99KJ0 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ubxn2aQ99KJ0 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Ubxn2aQ99KJ0 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ubxn2aQ99KJ0 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ubxn2aQ99KJ0 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ubxn2aQ99KJ0 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ubxn2aQ99KJ0 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ubxn2aQ99KJ0 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ubxn2aQ99KJ0 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ubxn2aQ99KJ0 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ubxn2aQ99KJ0 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ubxn2aQ99KJ0 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ubxn2aQ99KJ0 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ubxn2aQ99KJ0 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ubxn2aQ99KJ0 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ubxn2aQ99KJ0 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Ubxn2aQ99KJ0 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ubxn2aQ99KJ0 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Ubxn2aQ99KJ0 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Ubxn2aQ99KJ0 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ubxn2aQ99KJ0 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Ubxn2aQ99KJ0 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ubxn2aQ99KJ0 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ubxn2aQ99KJ0 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ubxn2aQ99KJ0 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ubxn2aQ99KJ0 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ubxn2aQ99KJ0 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ubxn2aQ99KJ0 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ubxn2aQ99KJ0 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ubxn2aQ99KJ0 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ubxn2aQ99KJ0 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Ubxn2aQ99KJ0 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ubxn2aQ99KJ0 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ubxn2aQ99KJ0 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ubxn2aQ99KJ0 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ubxn2aQ99KJ0 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ubxn2aQ99KJ0 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ubxn2aQ99KJ0 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ubxn2aQ99KJ0 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ubxn2aQ99KJ0 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ubxn2aQ99KJ0 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Ubxn2aQ99KJ0 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ubxn2aQ99KJ0 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ubxn2aQ99KJ0 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ubxn2aQ99KJ0 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ubxn2aQ99KJ0 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ubxn2aQ99KJ0 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ubxn2aQ99KJ0 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ubxn2aQ99KJ0 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ubxn2aQ99KJ0 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ubxn2aQ99KJ0 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ubxn2aQ99KJ0 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ubxn2aQ99KJ0 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ubxn2aQ99KJ0 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ubxn2aQ99KJ0 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ubxn2aQ99KJ0 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ubxn2aQ99KJ0 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ubxn2aQ99KJ0 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ubxn2aQ99KJ0 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ubxn2aQ99KJ0 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ubxn2aQ99KJ0 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ubxn2aQ99KJ0 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ubxn2aQ99KJ0 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Ubxn2aQ99KJ0 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ubxn2aQ99KJ0 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ubxn2aQ99KJ0 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ubxn2aQ99KJ0 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ubxn2aQ99KJ0 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ubxn2aQ99KJ0 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ubxn2aQ99KJ0 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ubxn2aQ99KJ0 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ubxn2aQ99KJ0 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ubxn2aQ99KJ0 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms