Protein–RNA interactions for Protein: Q99K46

Usp11, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 11, mousemouse

Predictions only

Length 921 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp11Q99K46 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp11Q99K46 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp11Q99K46 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp11Q99K46 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp11Q99K46 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp11Q99K46 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp11Q99K46 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp11Q99K46 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp11Q99K46 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp11Q99K46 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp11Q99K46 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp11Q99K46 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp11Q99K46 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp11Q99K46 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp11Q99K46 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp11Q99K46 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp11Q99K46 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp11Q99K46 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp11Q99K46 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp11Q99K46 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp11Q99K46 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp11Q99K46 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp11Q99K46 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp11Q99K46 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp11Q99K46 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp11Q99K46 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp11Q99K46 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp11Q99K46 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp11Q99K46 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp11Q99K46 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp11Q99K46 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp11Q99K46 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp11Q99K46 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp11Q99K46 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp11Q99K46 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp11Q99K46 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp11Q99K46 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp11Q99K46 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp11Q99K46 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp11Q99K46 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp11Q99K46 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp11Q99K46 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp11Q99K46 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp11Q99K46 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp11Q99K46 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp11Q99K46 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Usp11Q99K46 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Usp11Q99K46 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Usp11Q99K46 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Usp11Q99K46 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Usp11Q99K46 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Usp11Q99K46 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Usp11Q99K46 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Usp11Q99K46 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Usp11Q99K46 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Usp11Q99K46 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Usp11Q99K46 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Usp11Q99K46 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Usp11Q99K46 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Usp11Q99K46 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Usp11Q99K46 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Usp11Q99K46 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Usp11Q99K46 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Usp11Q99K46 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Usp11Q99K46 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Usp11Q99K46 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Usp11Q99K46 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Usp11Q99K46 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Usp11Q99K46 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Usp11Q99K46 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Usp11Q99K46 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Usp11Q99K46 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp11Q99K46 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp11Q99K46 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp11Q99K46 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp11Q99K46 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp11Q99K46 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp11Q99K46 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp11Q99K46 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp11Q99K46 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp11Q99K46 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp11Q99K46 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp11Q99K46 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp11Q99K46 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp11Q99K46 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp11Q99K46 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp11Q99K46 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp11Q99K46 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp11Q99K46 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp11Q99K46 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp11Q99K46 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp11Q99K46 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp11Q99K46 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp11Q99K46 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp11Q99K46 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp11Q99K46 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp11Q99K46 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp11Q99K46 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp11Q99K46 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp11Q99K46 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms