Protein–RNA interactions for Protein: Q99JR8

Smarcd2, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily D member 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarcd2Q99JR8 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Smarcd2Q99JR8 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smarcd2Q99JR8 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smarcd2Q99JR8 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smarcd2Q99JR8 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smarcd2Q99JR8 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smarcd2Q99JR8 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smarcd2Q99JR8 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smarcd2Q99JR8 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smarcd2Q99JR8 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smarcd2Q99JR8 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smarcd2Q99JR8 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smarcd2Q99JR8 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Smarcd2Q99JR8 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Smarcd2Q99JR8 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Smarcd2Q99JR8 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Smarcd2Q99JR8 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Smarcd2Q99JR8 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Smarcd2Q99JR8 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Smarcd2Q99JR8 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Smarcd2Q99JR8 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Smarcd2Q99JR8 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Smarcd2Q99JR8 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Smarcd2Q99JR8 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Smarcd2Q99JR8 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Smarcd2Q99JR8 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Smarcd2Q99JR8 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Smarcd2Q99JR8 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Smarcd2Q99JR8 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Smarcd2Q99JR8 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Smarcd2Q99JR8 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Smarcd2Q99JR8 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Smarcd2Q99JR8 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Smarcd2Q99JR8 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Smarcd2Q99JR8 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Smarcd2Q99JR8 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smarcd2Q99JR8 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smarcd2Q99JR8 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smarcd2Q99JR8 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smarcd2Q99JR8 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smarcd2Q99JR8 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smarcd2Q99JR8 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smarcd2Q99JR8 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smarcd2Q99JR8 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smarcd2Q99JR8 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Smarcd2Q99JR8 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smarcd2Q99JR8 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smarcd2Q99JR8 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smarcd2Q99JR8 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Smarcd2Q99JR8 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smarcd2Q99JR8 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smarcd2Q99JR8 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smarcd2Q99JR8 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smarcd2Q99JR8 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smarcd2Q99JR8 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smarcd2Q99JR8 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smarcd2Q99JR8 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smarcd2Q99JR8 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smarcd2Q99JR8 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smarcd2Q99JR8 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smarcd2Q99JR8 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smarcd2Q99JR8 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smarcd2Q99JR8 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smarcd2Q99JR8 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smarcd2Q99JR8 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smarcd2Q99JR8 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smarcd2Q99JR8 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smarcd2Q99JR8 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smarcd2Q99JR8 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smarcd2Q99JR8 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smarcd2Q99JR8 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smarcd2Q99JR8 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smarcd2Q99JR8 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smarcd2Q99JR8 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smarcd2Q99JR8 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Smarcd2Q99JR8 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smarcd2Q99JR8 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smarcd2Q99JR8 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smarcd2Q99JR8 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smarcd2Q99JR8 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smarcd2Q99JR8 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smarcd2Q99JR8 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smarcd2Q99JR8 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smarcd2Q99JR8 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smarcd2Q99JR8 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smarcd2Q99JR8 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smarcd2Q99JR8 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smarcd2Q99JR8 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smarcd2Q99JR8 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smarcd2Q99JR8 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smarcd2Q99JR8 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smarcd2Q99JR8 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smarcd2Q99JR8 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smarcd2Q99JR8 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smarcd2Q99JR8 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smarcd2Q99JR8 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smarcd2Q99JR8 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smarcd2Q99JR8 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Smarcd2Q99JR8 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Smarcd2Q99JR8 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms